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Дата изменения: Fri Oct 5 09:46:58 2012
Дата индексирования: Mon Feb 4 07:53:10 2013
Кодировка:

Поисковые слова: n 49
# File 2qkk.pdb4.pdb, PDB XXXX
# Hydrogen bonds
# NA Atom Protein Atom Dist. Theta1 Theta2 Phi1 Phi2 Power
C4:O.OP2/1 LYS236:N.NZ/1 3.49 1.02 1.17 0.73 -2.41 0.104
C4:O.O3'/1 HIS260:M.NE2/1 3.05 0.63 0.43 2.45 -0.69 0.576
C4:O.O2'/1 ASN210:M.O/1 2.72 0.78 1.03 1.22 -1.92 0.494
C4:O.O2'/1 MET212:M.N/1 2.96 0.77 0.12 -1.99 1.15 0.516
A5:O.O5'/1 ASN210:M.O/1 2.69 0.34 0.33 1.41 -1.73 0.150
A5:O.O2'/1 GLU186:M.OE1/1 2.16 0.58 0.65 1.14 -2.00 0.115
A5:O.N3/1 ASN182:M.OD1/1 2.90 0.77 1.04 -0.30 2.85 0.452
C6:O.O3'/1 CYS148:M.N/1 3.28 0.50 0.26 0.05 -3.09 0.358
C6:O.O2'/1 CYS148:M.O/1 2.41 0.82 0.78 0.49 -2.65 0.332
C6:O.O2/1 ASN151:M.ND2/1 3.35 0.86 1.36 -0.99 2.15 0.153
C7:O.O3'/1 SER150:M.N/1 3.19 0.22 0.25 -0.67 2.47 0.580
C13:O.O3'/1 ARG278:N.NH1/1 3.21 0.79 0.88 2.71 -0.43 0.178
C14:O.OP1/1 ARG278:N.NH1/1 2.59 1.14 1.03 -2.65 0.49 0.923
DA18:P.N3/1 ASN182:N.OD1/1 2.74 0.17 0.80 2.63 -0.52 0.579
DT19:P.OP1/1 THR181:N.OG1/1 2.82 1.14 1.06 1.73 -1.41 0.871
DT19:P.OP1/1 ASN240:N.OD1/1 2.71 1.11 0.79 -1.86 1.28 0.549
DT19:P.OP2/1 ARG179:N.NH1/1 2.55 1.02 0.63 2.82 -0.32 0.326
DT19:P.O5'/1 GLN183:N.NE2/1 2.98 0.63 1.01 0.04 -3.10 0.618
DT19:P.O5'/1 ASN240:N.ND2/1 3.25 0.91 1.25 -1.94 1.20 0.111
DA21:P.OP1/1 TRP225:N.NE1/1 2.95 0.91 0.40 3.01 -0.13 0.706
DG22:P.N7/1 SER233:N.OG/1 2.49 0.64 0.96 -2.83 0.31 0.588
DG25:P.O4'/1 ASN151:M.ND2/1 3.15 0.49 1.12 1.11 -2.04 0.599
DG25:P.N2/1 GLN183:M.OE1/1 3.10 1.71 1.16 -0.83 2.32 0.127
DG25:P.N3/1 GLN183:M.OE1/1 2.79 0.88 1.23 -2.81 0.33 0.295
DT26:P.OP1/1 ARG179:M.NH2/1 3.23 0.99 1.19 -0.18 2.96 0.439
DT26:P.OP1/1 THR181:M.OG1/1 2.76 1.19 0.83 0.97 -2.17 0.600
DT26:P.OP1/1 ASN240:M.ND2/1 3.09 0.90 1.12 -2.85 0.30 0.581
DT26:P.OP2/1 ARG179:M.NH1/1 3.20 1.26 0.88 0.09 -3.05 0.385
DC27:P.OP1/1 ILE239:M.N/1 3.04 0.60 0.29 0.08 -3.06 0.284
DG28:P.OP1/1 TRP225:M.NE1/1 3.15 1.02 0.37 1.03 -2.11 0.582
DG28:P.OP1/1 SER233:M.N/1 2.89 1.36 1.02 -1.25 1.89 0.102
DG28:P.OP2/1 SER233:M.N/1 3.21 1.59 0.58 -1.14 2.00 0.143
# Water bridges
# NA Atom Protein Atom NA-HOH Prot.-HOH Theta1 Theta2 Phi1 Phi2 Power
U12:O.O2'/1 ASN182:N.ND2/1 2.38 2.71 1.44 0.47 -2.91 0.24 0.141
U12:O.O2/1 ASN182:N.ND2/1 2.71 2.71 0.86 0.47 2.85 0.24 0.148