Подготовим файл координат и файл топологии. В прошлом занятии был предоставлен gro файл с 38 молекулами этана. ... Даны 5 файлов с разными параметрами контроля температуры: . be.mdp - метод Берендсена для контроля температуры. vr.mdp - метод "Velocity rescale" для контроля температуры. nh.mdp - метод Нуза-Хувера для контроля температуры. an.mdp - метод Андерсена для контроля температуры. sd.mdp - метод стохастической молекулярной динамики. Напишем скрипт для работы с 5ю системами. ...