. Введение в PyMOL . Cеми-эмпирические вычисления: Mopac . Abinitio вычисления для нафталина и азулена . Вычисление параметров для молекулярной механики . Вычисление точечных зарядов и VdW параметров для молекулярной механики . Изучение работы методов контроля температуры в GROMACS . Молекулярная динамика биологических молекул в GROMACS . Гомологичное моделирование комплекса белка с лигандом . Докинг низкомолекулярных лигандов в структуру белка .