Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес
оригинального документа
: http://kodomo.cmm.msu.su/FBB/year_07/term2/task4add.html
Дата изменения: Sun Mar 2 18:03:44 2008
Дата индексирования: Mon Oct 1 22:15:23 2012
Кодировка: Windows-1251
Занятие 4
Дополнительные задания
Импортируйте последовательности,
которые Вы выравнивали в обязательном упражнении 3,
в GeneDoc. Попробуйте вручную воспроизвести выравнивание, полученное
программой bl2seq. Поскольку программа выдала одно или несколько
частичных выравниваний, а вам нужно сделать полное, можно против всех остатков,
не вошедших в частичные выравнивания, поставить гэпы. Ну а можно
попытаться найти что-нибудь разумное и вне выданных выравниваний.
Поэкспериментируйте с программой bl2seq попробуйте
поменять матрицу или штрафы за гэпы. Опишите результаты в протоколе.