|
проф. Немухин Александр
Владимирович
Лаборатория химической кибернетики,
Кафедра физической химии,
Химический факультет,
МГУ им. М.В. Ломоносова,
119991 Россия Москва
Образование:
- Диплом (химия), 1969, Химический факультет МГУ им. М.В.
Ломоносова
- Кандидат химических наук (физическая химия), 1975,
Химический факультет МГУ им. М.В. Ломоносова; диссертация:
"Двухатомные потенциальные кривые в задачах молекулярной
спектроскопии и атомного рассеяния"
- Доктор химических наук (физическая химия), 1989, Химический
факультет МГУ им. М.В. Ломоносова; диссертация:
"Многоконфигурационные подходы в теории электронного строения
молекул"
Карьера:
- 2005- настоящее время: заведующий лабораторией компьютерного
моделирования биомолекул и наноматериалов Института
биохимической физики им. Н.М. Эмануэля РАН
- 1993 - настоящее время: заведующий лабораторией химической
кибернетики кафедры физической химии Химического факультета МГУ
им. М.В.Ломоносова
- 1991 - настоящее время: профессор кафедры физической химии
Химического факультета МГУ им. М.В.Ломоносова
- 1985 - 1991: доцент кафедры физической химии Химического
факультета МГУ им. М.В.Ломоносова
- 1975 - 1985: старший научный сотрудник кафедры физической
химии Химического факультета МГУ им. М.В.Ломоносова
- 1969 - 1975: младший научный сотрудник кафедры физической
химии Химического факультета МГУ им. М.В.Ломоносова
Область специализации:
- Квантовая и вычислительная химия
- Моделирование в химии и биохимии
- Молекулярная спектроскопия
- Молекулярная динамика
- Компьютерное программирование
Преподавательская деятельность:
Лекции:
- Квантовая механика и строение молекул
- Физическая химия твердого тела
- Молекулярное моделирование
- Классическая механика и теория поля
- Квантовая химия
- Математические методы в химии
Научный руководитель 9 диссертационных работ по квантовой
и вычислительной химии.
Куратор студенческой группы химиков-вычислителей на химическом факультете МГУ.
Награды:
- Государственная стипендия для ученых России: 1997-1999,
2000-2003 гг
- Соросовский профессор: 1997 - 2000 гг
- Гранты Москвы в области естественных наук: 2001-2004 гг
Последние публикации:
1 |
Grigorenko B.L.
Rogov A.V.
Topol I.A. Burt S.K. Martinez H.M. Nemukhin A.V. |
Mechanism of the myosin catalyzed hydrolysis of ATP
as rationalized by molecular modeling |
Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2007, V.104, #17, P.7057-7061 |
2 |
Rogacheva M.V.
Bochenkova A.V. Kuznetsova S.A. Sarabaev M.K. Nemukhin A.V. |
Impact of pyrophosphate and o-ethyl-substituted
pyrophosphate groups on DNA structure |
J. Phys. Chem. B 2007 ,V.111, P.432-438 |
3 |
Grigorenko B.L.
Nemukhin A.V. Shadrina M.S. Topol I.A. Burt S.K. |
Mechanisms of guanosine triphosphate hydrolysis by
Ras and Ras-GAP proteins as rationalized by ab initio QM/MM simulations |
Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics
2007, V.66, P.456-466 |
4 |
Topol I.A.
Nemukhin A.V. Salnikow K. Cachau R.E. Abashkin Yu.G.
Kasprzak K.S. Burt S.K. |
Quantum chemical modeling of reaction mechanism for
2-oxoglutarate dependent enzymes: Effect of substitution of iron by nickel and
cobalt |
J. Phys. Chem. A 2006 ,V.110, P.4223-4228 |
5 |
Nemukhin A.V. Topol I.A. Cachau R.E.
Burt S.K. |
On the nature of oxoiron (IV) intermediate in
dioxygen activation by non-heme enzymes |
Theoretical Chemistry Accounts 2006, V.115, P.348-353 |
6 |
Nemukhin A.V. Grigorenko B.L. Topol I.A.
Burt S.K. |
Modeling dioxygen binding to the non-heme
iron-containing enzymes |
Intern. J. Quantum Chem. 2006, V.106, P.2184-2190 |
7 |
Nemukhin A.V. Gariev I.A. Rogov A.V.
Varfolomeev S.D. |
Serine hydrolase catalytic sites: Geometry invariants
and modeling catalytic activity |
Mendeleev Communications 2006, V.16, #6,
P.290-292 |
8 |
Grigorenko B.L.
Savitsky A.P. Topol I.A. Burt S.K. Nemukhin A.V. |
Ground-state structures and vertical excitations for
the kindling fluorescent protein asFP595 |
J. Phys. Chem. B 2006 ,V.110, P.18635-18640 |
9 |
Bravaya K.B.
Bochenkova A.V. Grigorenko B.L.
Topol I.A. Burt S.K. Nemukhin A.V. |
Molecular modeling the reaction mechanism of
serine-carboxyl peptidases |
J. Chem. Theory and Computation 2006, V.2, P.1168-1175 |
10 |
Nemukhin A.V. Topol I.A. Burt S.K. |
Electronic excitations of the chromophore from the
fluorescent protein asFP595 in solutions |
J. Chem. Theory and Computation 2006, V.2, P.292-299 |
11 |
Grigorenko B.L.
Rogov A.V. Nemukhin A.V. |
Mechanism of triphosphate hydrolysis in aqueous
solution: QM/MM simulations in water clusters |
J. Phys. Chem. B 2006 ,V.110, P.4407-4412 |
12 |
Moskovsky A.A. Vanovschi V.V. Konyukhov S.S. Nemukhin A.V. |
Implementation of the replica-exchange molecular
dynamics method for rigid bodies |
Intern. J. Quantum Chem. 2006, V.106, #10, P.2208-2213 |
Most cited previous publications:
1 |
Nemukhin A.V.
Grigorenko B.L.
Khriachtchev L.Yu.
Tanskanen H.
Pettersson M.
Rдsдnen M. |
Intermolecular complexes of HXeOH with water:
Stabilization and destabilization effects |
J. Amer. Chem. Soc. 2002, V.124,
P.10706-10711 |
2 |
Grigorenko B.L.
Nemukhin A.V.
Buchachenko A.A.
Stepanov N.F.
Umanskii S.Ya. |
Diatomics-in-molecules description of the
Rg-Hal2 rare gas-halogen van der Waals complexes with
applications to He-Cl2 |
J.Chem. Phys., 1997, V.106, P.4575 |
3 |
Nemukhin A.V. Grigorenko B.L.
Topol I.A. Burt S.K. |
Modeling of biomolecular systems with the
quantum mechanical and molecular mechanical method based on the effective
fragment potential technique: Proposal of flexible fragments |
J. Phys. Chem. A 2002 ,V.106,
P.10663-10672 |
4 |
Topol I.A.
Nemukhin A.V.
Ming Chao
Iyer L.K.
Tawa G.J.
Burt S.K.
|
Quantum chemical studies of reactions of the
cyclic disulfides with the zinc finger domains in the HIV-1 nucleocapsid
protein (NCp7) |
J. Amer. Chem. Soc. 2000, V.122,
P.7087-7094 |
5 |
Grigorenko B.L.
Nemukhin A.V.
Apkarian V.A. |
Many-body potentials and dynamics based on
diatomics-in-molecules: Vibrational frequency shifts in ArnHF
(n=1-12,62) clusters |
J.Chem. Phys., 1996, V.104, P.5510 |
6 |
Buchachenko A.A.
Stepanov N.F.
Grigorenko B.L.
Nemukhin A.V. |
ArHF vibrational predissociation dynamics using
the diatomics-in-molecules potential energy surface |
J. Chem. Phys. 1999, V.111, P.2470-2477 |
7 |
Nemukhin A.V. Grigorenko B.L.
Topol I.A. Burt S.K. |
Flexible effective fragment QM/MM method:
Validation through the challenging tests |
J. Comput. Chem. 2003 ,V.24, P.1410-1420 |
|