Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://mouse.belozersky.msu.ru/npidb/data/pdb_new/wlake/npidb_script Дата изменения: Fri Oct 26 17:22:21 2012 Дата индексирования: Sun Feb 3 13:39:04 2013 Кодировка:

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echo \ >> d.58.8.1.finalxml
cat d.58.8.1.myxml >> d.58.8.1.finalxml
echo \ >> d.58.8.1.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/d.88.1.1.pdb descript=olga_domain-model.xml family=d.88.1.1 out_pdb=d.88.1.1.mypdb
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echo \ > d.88.1.1.finalxml
echo \ >> d.88.1.1.finalxml
cat d.88.1.1.myxml >> d.88.1.1.finalxml
echo \ >> d.88.1.1.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/c.52.1.15.pdb descript=olga_domain-model.xml family=c.52.1.15 out_pdb=c.52.1.15.mypdb
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echo \ >> c.52.1.15.finalxml
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echo \ > a.4.5.10.finalxml
echo \ >> a.4.5.10.finalxml
cat a.4.5.10.myxml >> a.4.5.10.finalxml
echo \ >> a.4.5.10.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/a.4.5.12.pdb descript=olga_domain-model.xml family=a.4.5.12 out_pdb=a.4.5.12.mypdb
./wLake17 -x a.4.5.12.task
./x_join a.4.5.12.wLake a.4.5.12.myxml
./x_scr a.4.5.12.myxml > a.4.5.12.spt
echo \ > a.4.5.12.finalxml
echo \ >> a.4.5.12.finalxml
cat a.4.5.12.myxml >> a.4.5.12.finalxml
echo \ >> a.4.5.12.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/a.4.5.21.pdb descript=olga_domain-model.xml family=a.4.5.21 out_pdb=a.4.5.21.mypdb
./wLake17 -x a.4.5.21.task
./x_join a.4.5.21.wLake a.4.5.21.myxml
./x_scr a.4.5.21.myxml > a.4.5.21.spt
echo \ > a.4.5.21.finalxml
echo \ >> a.4.5.21.finalxml
cat a.4.5.21.myxml >> a.4.5.21.finalxml
echo \ >> a.4.5.21.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/a.4.5.6.pdb descript=olga_domain-model.xml family=a.4.5.6 out_pdb=a.4.5.6.mypdb
./wLake17 -x a.4.5.6.task
./x_join a.4.5.6.wLake a.4.5.6.myxml
./x_scr a.4.5.6.myxml > a.4.5.6.spt
echo \ > a.4.5.6.finalxml
echo \ >> a.4.5.6.finalxml
cat a.4.5.6.myxml >> a.4.5.6.finalxml
echo \ >> a.4.5.6.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/a.4.6.1.pdb descript=olga_domain-model.xml family=a.4.6.1 out_pdb=a.4.6.1.mypdb
./wLake17 -x a.4.6.1.task
./x_join a.4.6.1.wLake a.4.6.1.myxml
./x_scr a.4.6.1.myxml > a.4.6.1.spt
echo \ > a.4.6.1.finalxml
echo \ >> a.4.6.1.finalxml
cat a.4.6.1.myxml >> a.4.6.1.finalxml
echo \ >> a.4.6.1.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/a.4.1.6.pdb descript=olga_domain-model.xml family=a.4.1.6 out_pdb=a.4.1.6.mypdb
./wLake17 -x a.4.1.6.task
./x_join a.4.1.6.wLake a.4.1.6.myxml
./x_scr a.4.1.6.myxml > a.4.1.6.spt
echo \ > a.4.1.6.finalxml
echo \ >> a.4.1.6.finalxml
cat a.4.1.6.myxml >> a.4.1.6.finalxml
echo \ >> a.4.1.6.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/b.2.5.2.pdb descript=olga_domain-model.xml family=b.2.5.2 out_pdb=b.2.5.2.mypdb
./wLake17 -x b.2.5.2.task
./x_join b.2.5.2.wLake b.2.5.2.myxml
./x_scr b.2.5.2.myxml > b.2.5.2.spt
echo \ > b.2.5.2.finalxml
echo \ >> b.2.5.2.finalxml
cat b.2.5.2.myxml >> b.2.5.2.finalxml
echo \ >> b.2.5.2.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/b.2.5.7.pdb descript=olga_domain-model.xml family=b.2.5.7 out_pdb=b.2.5.7.mypdb
./wLake17 -x b.2.5.7.task
./x_join b.2.5.7.wLake b.2.5.7.myxml
./x_scr b.2.5.7.myxml > b.2.5.7.spt
echo \ > b.2.5.7.finalxml
echo \ >> b.2.5.7.finalxml
cat b.2.5.7.myxml >> b.2.5.7.finalxml
echo \ >> b.2.5.7.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/c.52.1.10.pdb descript=olga_domain-model.xml family=c.52.1.10 out_pdb=c.52.1.10.mypdb
./wLake17 -x c.52.1.10.task
./x_join c.52.1.10.wLake c.52.1.10.myxml
./x_scr c.52.1.10.myxml > c.52.1.10.spt
echo \ > c.52.1.10.finalxml
echo \ >> c.52.1.10.finalxml
cat c.52.1.10.myxml >> c.52.1.10.finalxml
echo \ >> c.52.1.10.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/d.163.1.1.pdb descript=olga_domain-model.xml family=d.163.1.1 out_pdb=d.163.1.1.mypdb
./wLake17 -x d.163.1.1.task
./x_join d.163.1.1.wLake d.163.1.1.myxml
./x_scr d.163.1.1.myxml > d.163.1.1.spt
echo \ > d.163.1.1.finalxml
echo \ >> d.163.1.1.finalxml
cat d.163.1.1.myxml >> d.163.1.1.finalxml
echo \ >> d.163.1.1.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/d.285.1.1.pdb descript=olga_domain-model.xml family=d.285.1.1 out_pdb=d.285.1.1.mypdb
./wLake17 -x d.285.1.1.task
./x_join d.285.1.1.wLake d.285.1.1.myxml
./x_scr d.285.1.1.myxml > d.285.1.1.spt
echo \ > d.285.1.1.finalxml
echo \ >> d.285.1.1.finalxml
cat d.285.1.1.myxml >> d.285.1.1.finalxml
echo \ >> d.285.1.1.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/g.38.1.1.pdb descript=olga_domain-model.xml family=g.38.1.1 out_pdb=g.38.1.1.mypdb
./wLake17 -x g.38.1.1.task
./x_join g.38.1.1.wLake g.38.1.1.myxml
./x_scr g.38.1.1.myxml > g.38.1.1.spt
echo \ > g.38.1.1.finalxml
echo \ >> g.38.1.1.finalxml
cat g.38.1.1.myxml >> g.38.1.1.finalxml
echo \ >> g.38.1.1.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/g.39.1.2.pdb descript=olga_domain-model.xml family=g.39.1.2 out_pdb=g.39.1.2.mypdb
./wLake17 -x g.39.1.2.task
./x_join g.39.1.2.wLake g.39.1.2.myxml
./x_scr g.39.1.2.myxml > g.39.1.2.spt
echo \ > g.39.1.2.finalxml
echo \ >> g.39.1.2.finalxml
cat g.39.1.2.myxml >> g.39.1.2.finalxml
echo \ >> g.39.1.2.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/a.4.5.20.pdb descript=olga_domain-model.xml family=a.4.5.20 out_pdb=a.4.5.20.mypdb
./wLake17 -x a.4.5.20.task
./x_join a.4.5.20.wLake a.4.5.20.myxml
./x_scr a.4.5.20.myxml > a.4.5.20.spt
echo \ > a.4.5.20.finalxml
echo \ >> a.4.5.20.finalxml
cat a.4.5.20.myxml >> a.4.5.20.finalxml
echo \ >> a.4.5.20.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/b.2.5.6.pdb descript=olga_domain-model.xml family=b.2.5.6 out_pdb=b.2.5.6.mypdb
./wLake17 -x b.2.5.6.task
./x_join b.2.5.6.wLake b.2.5.6.myxml
./x_scr b.2.5.6.myxml > b.2.5.6.spt
echo \ > b.2.5.6.finalxml
echo \ >> b.2.5.6.finalxml
cat b.2.5.6.myxml >> b.2.5.6.finalxml
echo \ >> b.2.5.6.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/c.52.1.3.pdb descript=olga_domain-model.xml family=c.52.1.3 out_pdb=c.52.1.3.mypdb
./wLake17 -x c.52.1.3.task
./x_join c.52.1.3.wLake c.52.1.3.myxml
./x_scr c.52.1.3.myxml > c.52.1.3.spt
echo \ > c.52.1.3.finalxml
echo \ >> c.52.1.3.finalxml
cat c.52.1.3.myxml >> c.52.1.3.finalxml
echo \ >> c.52.1.3.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/d.4.1.3.pdb descript=olga_domain-model.xml family=d.4.1.3 out_pdb=d.4.1.3.mypdb
./wLake17 -x d.4.1.3.task
./x_join d.4.1.3.wLake d.4.1.3.myxml
./x_scr d.4.1.3.myxml > d.4.1.3.spt
echo \ > d.4.1.3.finalxml
echo \ >> d.4.1.3.finalxml
cat d.4.1.3.myxml >> d.4.1.3.finalxml
echo \ >> d.4.1.3.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/b.2.5.5.pdb descript=olga_domain-model.xml family=b.2.5.5 out_pdb=b.2.5.5.mypdb
./wLake17 -x b.2.5.5.task
./x_join b.2.5.5.wLake b.2.5.5.myxml
./x_scr b.2.5.5.myxml > b.2.5.5.spt
echo \ > b.2.5.5.finalxml
echo \ >> b.2.5.5.finalxml
cat b.2.5.5.myxml >> b.2.5.5.finalxml
echo \ >> b.2.5.5.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/c.52.1.6.pdb descript=olga_domain-model.xml family=c.52.1.6 out_pdb=c.52.1.6.mypdb
./wLake17 -x c.52.1.6.task
./x_join c.52.1.6.wLake c.52.1.6.myxml
./x_scr c.52.1.6.myxml > c.52.1.6.spt
echo \ > c.52.1.6.finalxml
echo \ >> c.52.1.6.finalxml
cat c.52.1.6.myxml >> c.52.1.6.finalxml
echo \ >> c.52.1.6.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/d.228.1.1.pdb descript=olga_domain-model.xml family=d.228.1.1 out_pdb=d.228.1.1.mypdb
./wLake17 -x d.228.1.1.task
./x_join d.228.1.1.wLake d.228.1.1.myxml
./x_scr d.228.1.1.myxml > d.228.1.1.spt
echo \ > d.228.1.1.finalxml
echo \ >> d.228.1.1.finalxml
cat d.228.1.1.myxml >> d.228.1.1.finalxml
echo \ >> d.228.1.1.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/c.55.3.4.pdb descript=olga_domain-model.xml family=c.55.3.4 out_pdb=c.55.3.4.mypdb
./wLake17 -x c.55.3.4.task
./x_join c.55.3.4.wLake c.55.3.4.myxml
./x_scr c.55.3.4.myxml > c.55.3.4.spt
echo \ > c.55.3.4.finalxml
echo \ >> c.55.3.4.finalxml
cat c.55.3.4.myxml >> c.55.3.4.finalxml
echo \ >> c.55.3.4.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/c.66.1.26.pdb descript=olga_domain-model.xml family=c.66.1.26 out_pdb=c.66.1.26.mypdb
./wLake17 -x c.66.1.26.task
./x_join c.66.1.26.wLake c.66.1.26.myxml
./x_scr c.66.1.26.myxml > c.66.1.26.spt
echo \ > c.66.1.26.finalxml
echo \ >> c.66.1.26.finalxml
cat c.66.1.26.myxml >> c.66.1.26.finalxml
echo \ >> c.66.1.26.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/a.18.1.1.pdb descript=olga_domain-model.xml family=a.18.1.1 out_pdb=a.18.1.1.mypdb
./wLake17 -x a.18.1.1.task
./x_join a.18.1.1.wLake a.18.1.1.myxml
./x_scr a.18.1.1.myxml > a.18.1.1.spt
echo \ > a.18.1.1.finalxml
echo \ >> a.18.1.1.finalxml
cat a.18.1.1.myxml >> a.18.1.1.finalxml
echo \ >> a.18.1.1.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/a.96.1.1.pdb descript=olga_domain-model.xml family=a.96.1.1 out_pdb=a.96.1.1.mypdb
./wLake17 -x a.96.1.1.task
./x_join a.96.1.1.wLake a.96.1.1.myxml
./x_scr a.96.1.1.myxml > a.96.1.1.spt
echo \ > a.96.1.1.finalxml
echo \ >> a.96.1.1.finalxml
cat a.96.1.1.myxml >> a.96.1.1.finalxml
echo \ >> a.96.1.1.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/a.96.1.3.pdb descript=olga_domain-model.xml family=a.96.1.3 out_pdb=a.96.1.3.mypdb
./wLake17 -x a.96.1.3.task
./x_join a.96.1.3.wLake a.96.1.3.myxml
./x_scr a.96.1.3.myxml > a.96.1.3.spt
echo \ > a.96.1.3.finalxml
echo \ >> a.96.1.3.finalxml
cat a.96.1.3.myxml >> a.96.1.3.finalxml
echo \ >> a.96.1.3.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/c.18.1.1.pdb descript=olga_domain-model.xml family=c.18.1.1 out_pdb=c.18.1.1.mypdb
./wLake17 -x c.18.1.1.task
./x_join c.18.1.1.wLake c.18.1.1.myxml
./x_scr c.18.1.1.myxml > c.18.1.1.spt
echo \ > c.18.1.1.finalxml
echo \ >> c.18.1.1.finalxml
cat c.18.1.1.myxml >> c.18.1.1.finalxml
echo \ >> c.18.1.1.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/a.55.1.1.pdb descript=olga_domain-model.xml family=a.55.1.1 out_pdb=a.55.1.1.mypdb
./wLake17 -x a.55.1.1.task
./x_join a.55.1.1.wLake a.55.1.1.myxml
./x_scr a.55.1.1.myxml > a.55.1.1.spt
echo \ > a.55.1.1.finalxml
echo \ >> a.55.1.1.finalxml
cat a.55.1.1.myxml >> a.55.1.1.finalxml
echo \ >> a.55.1.1.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/d.75.2.1.pdb descript=olga_domain-model.xml family=d.75.2.1 out_pdb=d.75.2.1.mypdb
./wLake17 -x d.75.2.1.task
./x_join d.75.2.1.wLake d.75.2.1.myxml
./x_scr d.75.2.1.myxml > d.75.2.1.spt
echo \ > d.75.2.1.finalxml
echo \ >> d.75.2.1.finalxml
cat d.75.2.1.myxml >> d.75.2.1.finalxml
echo \ >> d.75.2.1.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/a.96.1.2.pdb descript=olga_domain-model.xml family=a.96.1.2 out_pdb=a.96.1.2.mypdb
./wLake17 -x a.96.1.2.task
./x_join a.96.1.2.wLake a.96.1.2.myxml
./x_scr a.96.1.2.myxml > a.96.1.2.spt
echo \ > a.96.1.2.finalxml
echo \ >> a.96.1.2.finalxml
cat a.96.1.2.myxml >> a.96.1.2.finalxml
echo \ >> a.96.1.2.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/b.113.1.1.pdb descript=olga_domain-model.xml family=b.113.1.1 out_pdb=b.113.1.1.mypdb
./wLake17 -x b.113.1.1.task
./x_join b.113.1.1.wLake b.113.1.1.myxml
./x_scr b.113.1.1.myxml > b.113.1.1.spt
echo \ > b.113.1.1.finalxml
echo \ >> b.113.1.1.finalxml
cat b.113.1.1.myxml >> b.113.1.1.finalxml
echo \ >> b.113.1.1.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/c.52.1.19.pdb descript=olga_domain-model.xml family=c.52.1.19 out_pdb=c.52.1.19.mypdb
./wLake17 -x c.52.1.19.task
./x_join c.52.1.19.wLake c.52.1.19.myxml
./x_scr c.52.1.19.myxml > c.52.1.19.spt
echo \ > c.52.1.19.finalxml
echo \ >> c.52.1.19.finalxml
cat c.52.1.19.myxml >> c.52.1.19.finalxml
echo \ >> c.52.1.19.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/b.2.5.4.pdb descript=olga_domain-model.xml family=b.2.5.4 out_pdb=b.2.5.4.mypdb
./wLake17 -x b.2.5.4.task
./x_join b.2.5.4.wLake b.2.5.4.myxml
./x_scr b.2.5.4.myxml > b.2.5.4.spt
echo \ > b.2.5.4.finalxml
echo \ >> b.2.5.4.finalxml
cat b.2.5.4.myxml >> b.2.5.4.finalxml
echo \ >> b.2.5.4.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/a.113.1.1.pdb descript=olga_domain-model.xml family=a.113.1.1 out_pdb=a.113.1.1.mypdb
./wLake17 -x a.113.1.1.task
./x_join a.113.1.1.wLake a.113.1.1.myxml
./x_scr a.113.1.1.myxml > a.113.1.1.spt
echo \ > a.113.1.1.finalxml
echo \ >> a.113.1.1.finalxml
cat a.113.1.1.myxml >> a.113.1.1.finalxml
echo \ >> a.113.1.1.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/a.2.8.1.pdb descript=olga_domain-model.xml family=a.2.8.1 out_pdb=a.2.8.1.mypdb
./wLake17 -x a.2.8.1.task
./x_join a.2.8.1.wLake a.2.8.1.myxml
./x_scr a.2.8.1.myxml > a.2.8.1.spt
echo \ > a.2.8.1.finalxml
echo \ >> a.2.8.1.finalxml
cat a.2.8.1.myxml >> a.2.8.1.finalxml
echo \ >> a.2.8.1.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/a.60.3.1.pdb descript=olga_domain-model.xml family=a.60.3.1 out_pdb=a.60.3.1.mypdb
./wLake17 -x a.60.3.1.task
./x_join a.60.3.1.wLake a.60.3.1.myxml
./x_scr a.60.3.1.myxml > a.60.3.1.spt
echo \ > a.60.3.1.finalxml
echo \ >> a.60.3.1.finalxml
cat a.60.3.1.myxml >> a.60.3.1.finalxml
echo \ >> a.60.3.1.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/b.56.1.1.pdb descript=olga_domain-model.xml family=b.56.1.1 out_pdb=b.56.1.1.mypdb
./wLake17 -x b.56.1.1.task
./x_join b.56.1.1.wLake b.56.1.1.myxml
./x_scr b.56.1.1.myxml > b.56.1.1.spt
echo \ > b.56.1.1.finalxml
echo \ >> b.56.1.1.finalxml
cat b.56.1.1.myxml >> b.56.1.1.finalxml
echo \ >> b.56.1.1.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/d.89.1.2.pdb descript=olga_domain-model.xml family=d.89.1.2 out_pdb=d.89.1.2.mypdb
./wLake17 -x d.89.1.2.task
./x_join d.89.1.2.wLake d.89.1.2.myxml
./x_scr d.89.1.2.myxml > d.89.1.2.spt
echo \ > d.89.1.2.finalxml
echo \ >> d.89.1.2.finalxml
cat d.89.1.2.myxml >> d.89.1.2.finalxml
echo \ >> d.89.1.2.finalxml

./cut_wat in_pdb=/data/npidb/olga/corrected/c.52.1.12.pdb descript=olga_domain-model.xml family=c.52.1.12 out_pdb=c.52.1.12.mypdb
./wLake17 -x c.52.1.12.task
./x_join c.52.1.12.wLake c.52.1.12.myxml
./x_scr c.52.1.12.myxml > c.52.1.12.spt
echo \ > c.52.1.12.finalxml
echo \ >> c.52.1.12.finalxml
cat c.52.1.12.myxml >> c.52.1.12.finalxml
echo \ >> c.52.1.12.finalxml