|
Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес
оригинального документа
: http://npidb.belozersky.msu.ru/families/contacttypesnew.html
Дата изменения: Unknown Дата индексирования: Sat Apr 9 22:26:34 2016 Кодировка: IBM-866 |
Interaction class
|
|
Class: H-Bb Description: Conserved protein-DNA contacts are provided by helix(es) (H) with DNA backbone atoms (Bb). |
| SCOP Domain Family | Number of structures |
Number of domains |
Interaction modes |
Ax-bend |
MnG width |
MnG depth |
MjG width |
MjG depth |
| Leucine zipper domain I (h.1.3.1) |
20 | 5 |
H-Bb H-Bb L-Bb L-Bb S-Bb S-Mn |
1.0 | 11.9 | 1.5 | тАУ | тАУ |
| Transcription factor IIB (TFIIB), core domain (a.74.1.2) |
16 | 4 |
H-Bb H-Bb H-Mj L-Bb H-Bb H-Mj L-Bb L-Mj H-Bb L-Bb H-Bb L-Bb L-Mj |
0.3 | 9.2 | 3.3 | тАУ | тАУ |
| AraC type transcriptional activator (a.4.1.8) |
10 | 4 |
H-Bb H-Bb H-Mj H-Bb H-Mj L-Bb H-Bb L-Bb |
0.7 (0.3тАУ1.4) | тАУ | тАУ | тАУ | тАУ |
| All SCOP domain families with determined protein-DNA interaction classes | ||||||||
|
|
