'Биоинформатика: задачи и модели'

профессор В.А. Любецкий

Биоинформатика в решающей степени основывается на компьютерном анализе данных и на создании высоко эффективных алгоритмов, программ и сред, в том числе, для параллельных вычислений. Здесь одной из важнейших задач является создание 'рабочего места биоинформатика', в котором были бы согласованно представлены все используемые средства поиска и анализа в базах данных, программы решения основных типов биоинформатических задач, графические средства представления исходных данных и результатов поиска, вычислений, и т.д.

С/с обращен к не специалистам в этой области (биологическая подготовка не требуется). На нем будут объяснены важные задачи из этой области, а желающим будут даны темы для дальнейших исследований: курсовых, дипломных, магистерских и научно-исследовательских работ. 

В частности, будут рассмотрены задачи (в основном, относящиеся к прокариотическому случаю):

ћ        Регуляция экспрессии генов (поиск сайтов белок-ДНКового взаимодействия и спиралей - специфических вторичных структур РНК).

ћ        Построение филогенетических деревьев генов (белков).

ћ        Построение филогенетических деревьев видов.

ћ        Реконструкция эволюционных событий.

ћ        Реконструкция метаболизма бактерий.

ћ        Аннотация генов.

ћ        Альтернативный сплайсинг (для эукариот).