Комбинаторная библиотека.

Исходная матрица для комбинаторной библиотеки получается химическим синтезом фрагмента ДНК, у которого в середине молекулы находятся около 30-60 нуклеотидов со случайной последовательностью, ограниченных участками с известной первичной структурой. Такие молекулы получают при ступенчатом автоматическом синтезе олигонуклеотида, вводя на каждой стадии конденсации не один, а сразу четыре активированных мономерных звена (синтона). Если вырожденный участок состоит из n последовательных нуклеотидов, то получается библиотека из Nmax= 4n отличных друг от друга по последовательности молекул ДНК.

константная часть               вырожденный район              константная часть

ДНК
GGGAATGGATCCACATCTACGAATTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTCACTGCAGACTTGACGAAGCTT
РНК
GGGAAUGGAUCCACAUCUACGAAUUCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnUUCACUGCAGACUUGACGAAGCUU
n ? любой из A, G, C, T (U)

Количество вариантов 4ⁿ

Длинна вырожденной последовательности		Количество вариантов
4		102
10		106
20		1013
30		1017
40		1023
60		1037
120		1072

-- AndreyGolovin - 2009-10-13