Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~vanilin/pfam.html
Дата изменения: Wed May 25 12:15:10 2005
Дата индексирования: Mon Oct 1 23:01:32 2012
Кодировка: Windows-1251

Domain На главную страницу второго семестра

Описание доменной структуры BTUB_ECOLI

Доменная структура

? Домена Идентификатор Pfam Cокращенное название Полное название Положение домена, а.о.

1 PF07715 Plug Plug домен TonB-зависимого рецептора 38-146
3 PF00593 TonB_dep_Rec TonB-зависимый рецептор 390-614

Изображение положения доменов

Идентификатор PDB 1nqf

Описание семейства доменов, к которому относится Plug домен BTUB_ECOLI

Характеристика семейства

Plug домен - независимо сворачивающаяся субъединица, связывающая TonB-зависимый рецептор. Он выполняет функцию ворот в канале белка, блокируя его, пока канал связан с лигандом. После этого с ним происходят конформационные изменения, и канал открывается.

Таксоны, содеражщие Plug домены

Таксон		Количество белков с доменом PF07715
Эукариоты	Растения	0
	Грибы	0
	Животные	1
Бактерии		1412
Археи		0

Доменная архитектура

Всего известно 1641 белков с доменом Plug.
Чаще всего домен Plug появляется вместе с доменом TonB_dep_Rec в 1420 белках. В 61 белке домен Plug - единственный.
Во всех белках домен Plug встречается только один раз
Случаев перестановки доменов местами не обнаружено

? Домена	Идентификатор Pfam	Cокращенное название	Полное название	Положение домена, а.о.
1	PF07715	Plug	Plug домен TonB-зависимого рецептора	38-146
3	PF00593	TonB_dep_Rec	TonB-зависимый рецептор	390-614