Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~zloygenii13/Shaitganov_cr31.doc Дата изменения: Fri Dec 29 19:01:18 2006 Дата индексирования: Tue Oct 2 05:16:20 2012 Кодировка: koi8-r

Анализ протеома бактерии T.Thermophilus штамм HB8 .

Шайтжанов Тимур. Студент 1 курса.


Введение.

[Русское название]
Русское название бактерии - .

Вид: T.Thermophilus
Род: Thermus
Семейство: Thermaceae
Порядок: Thermales
Класс: Deinococci
Царство: Deinococcus-Thermus
Империя:Bacteria

[pic]
Вид бактерии под микроскопом см. в файле S_simplicita.jpg (взят с сайта
http://www.molgen.mpg.de/~ag_ribo/ag_fucini/ffhistory/thermus_cells_small.jp
g Длина бактерии примерно 1,7м, толщина 1м
Среды обитания:
Термальные источники,бедные питательные среды,найдены в водопроводной воде.
manipulationThermus thermophilus является моделью организма для
генетических манипуляций.
Морские бактерии скоро станут частью кремов для защиты от солнечных ожогов.
Теплолюбивые бактерии, живущие в термальных источниках на дне океана,
вскоре могут стать прекрасным средством для защиты человеческой кожи от
опасного летнего солнца.

Одна из французских косметических компаний разработала специальный
наполнитель для солнцезащитных лосьонов, усиливающий защиту кожи по мере
роста температуры. Это стало возможным благодаря бактерии Thermus
thermophilus, преспокойно выживающей при температуре 75њC. В настоящее
время компания Sederma предполагает создать целую серию солнцезащитных
продуктов на основе T. thermophilus. Местом сбора микроорганизмов будут
термальные источники, находящиеся на дне моря в двух километрах от
Калифорнийского залива. Компоненты для своих продуктов Sederma будет
получать в ходе брожения T. thermophilus, однако сам процесс остается
секретом. По утверждению участников проекта результатом будет являться
"белковый коктейль", включающий в себя энзимы, особенно эффективные при
борьбе со свободными радикалами, возникающими под воздействием
ультрафиолетового света и вовлеченными в повреждающие кожу реакции.
Термальные источники на дне моря содержат большое количество свободных
радикалов, эффективные способы зашиты от которых и были найдены живущими
там микроорганизмами. Однако, в отличие от энзимов, они способны
функционировать при большой температуры. По утверждению компании Sederma,
эффективность новых ингридиентов при удалении перекиси водорода
увеличивается в три раза с ростом температуры от 40 њC до 25 њC.

Обитают в водопроводной воде. Просто добавить в нее капельку LA (совсем
чуть-чуть, не любят они богатые среды), подержать сутки при 65'С, а затем -
на агар (можно сначала промикроскопить, чтобы быть уверенным) и опять на
65'. Правда не во всех образцах получалось - похоже зависит от степени
ржавости труб водоснабжения.

Ну и проверить потом желательно: среда может зарасти термофильными
бациллами, эти заразы вездесущны. Кстати, термусы из водопровода часто
теряют пигментацию в отличие от гейзерных.
Большинство экстремальных термофилов, обитающие в геотермальных сред
строгим anaerobes как следствие адаптации к низкой растворимости кислорода
в этих температур. However, Thermus species are an exception because they
are strictly aerobic chemorganotrophs.Однако, Thermus виды являются
исключением потому, что они, строго аэробные chemorganotrophs. For example
Thermus thermophilus HB8 is able to grow anaerobically in the presence of
nitrate due to synthesis of the nitrate reductase complex encoded by the
nar operon.Например Thermus thermophilus HB8 имеет возможность расти
anaerobically в присутствии аммония, вследствие синтеза нитрат редуктазы
сложный просто декларативное operon. Expression from this operon is induced
under low oxygen concentrations when nitrate is present.Выражение этого
operon склоняют при низких концентрациях кислорода, когда нитратов
находится. T. thermophilus HB27 however, was unable to grow under these
anaerobic conditions.Т. thermophilus HB27 однако, не мог развиваться в
соответствии с этими анаэробных условиях. Researchers demonstrate that the
ability to grow anaerobically by nitrate reduction can be transferred to
the aerobic strain HB27 by conjugation.Исследователи показывают, что
способность расти anaerobically путем снижения нитратов могут быть
перенесены и на аэробной нагрузки HB27 путем конъюгации. This conjugation
event is dependent on the integration of a conjugative plasmid containing
the nar operon into the HB8 chromosome which can then mobilise the
chromosome in an Hfr-like (high frequency of recombination) mechanism which
can also mobilize other chromosomal markers in a time-dependent way.Это
событие спряжения зависит от интеграции коньюгированных плазмиды,
содержащие в узкий operon HB8 хромосомы которых можно мобилизовать на
хромосоме - как Хфр (высокая частота рекомбинации) механизм, который можно
также использовать другие хромосомные маркеры в зависящей от времени путь.
Besides the interest in basic research, e.g.Помимо интереса к
фундаментальным исследованиям, например the structural basis of protein
thermostability or the adaptation strategies for survival at high
temperatures, biotechnological applications of some thermostable enzymes
contribute to the interest in T. thermophilus .структурной основой белков
thermostability или адаптации стратегии выживания при высоких температурах,
биотехнологии Термостабильный некоторые ферменты способствуют интерес к Т.
thermophilus. This intrinsic stability and resistance to denaturing
physical and chemical factors are considerable advantages in industrial
processes.Эта неизменная стабильность и устойчивость к денату- рации
физических и химических факторов являются значительными преимуществами в
промышленном производстве. Some enzymes of Thermus species are already used
in biotechnological applications such as DNA polymerase, an indispensable
enzyme used in PCR techniques.Некоторые ферменты из Thermus видах уже
используются в биотехнологических приложений, таких как ДНК полимеразной,
необходимы ферменты, используемые в ПЦР технологии. Other fields of
application for thermostable enzymes are starch-processing ( e.g.
-amylases, glucose isomerases), organic synthesis ( e.g. esterases,
lipases, proteases), diagnostics, waste treatment, pulp and paper
manufacture ( e.g. xylanases), and animal feed and human food (amino acid
and vitamin synthesis).Другие сферы применения Термостабильный ферменты
являются крахмал обработки (например - amylases, isomerases глюкозы),
органического синтеза (например esterases, lipases, протеаз), диагностика,
обработка отходов, производстве целлюлозы и бумаги (например ксиланазы), и
кормов для животных и продуктов питания (аминокислот и синтез витаминов).
Researchers have begun to make comparisons between the mesophilic bacterium
Deinococcus radiodurans and T. thermophilus .Исследователи стали сравнивать
мезофильном бактерия Deinococcus radiodurans и T. thermophilus. Both
organisms share a similar set of proteins, although their genomes lack
extensive synteny.В обоих организмах доля аналогичный комплекс белков, хотя
их геномы отсутствие обширных synteny. Many new genes of potential interest
for biotechnological applications were found in T. thermophilus HB27.Многие
новые гены представляют потенциальный интерес для биотехнологии были
обнаружены в Т. thermophilus HB27. Candidates include various proteases and
key enzymes of other fundamental biological processes such as DNA
replication, DNA repair and RNA maturation.Кандидаты относятся различные
протеаз и ключевые ферменты других фундаментальных биологических процессов,
таких как ДНК, репликации, Репарацию ДНК и РНК созревание.
(http://translate.google.com/translate?hl=ru&sl=en&u=http://www.ebi.ac.uk/2c
an/genomes/bacteria/Thermus_thermophilus.html&sa=X&oi=translate&resnum=1&ct=
result&prev=/search%3Fq%3DT.Thermophilus%26hl%3Dru%26lr%3D )


Геном и протеом T.Thermophilus


Статистические данные о геноме приведены в табл.1 Они взяты с сайта
http://www.ebi.ac.uk/genomes/bacteria.html

Табл.1 Статистические данные о геноме T.Thermophilus
|Хромосома |Число пар |Число генов |Суммарная |Суммарная |GC |
|или плазмида|нуклеотидов | |длина генов |длина |состав|
| | | |(% от длины |межгенных |(%) |
| | | |хромосомы |промежутков| |
| | | |или |(%) | |
| | | |плазмиды) | | |
|Chromosome |1974 |1974 |18497442 | |69,5 |
|Plasmid |251 |251 |256992 | |69,4 |
|pTT27 | | | | | |
|Plasmid pTT8|14 |14 |9322 | |69 |
|(*) Всего |2239 | | | | |




Литература

|Ссылки : |
|http://www.g2l.bio.uni-goettingen.de/projects/c_proj_tt.htmlhttp://www.g2l|
|.bio.uni-goettingen.de/projects/c_proj_tt.html |
|http://www.tsukuba.ac.jp/eng/index.htmlhttp://www.tsukuba.ac.jp/eng/index.|
|html |
|http://www.nature.com/http://www.nature.com/ |
|http://www.science.siu.edu/microbiology/micr460/460%20Pages/460.horizanaer|
|ob.htmlhttp://www.science.siu.edu/microbiology/micr460/460% |
|20Pages/460.horizanaerob.html |
| |
| |