База данных Pfam
Ha главную страницу II семестра
Описание доменной структуры белка DTD_ECOLI
Изображение доменной структуры аминокислотной последовательности белка DTD_ECOLI
В белке DTD_ECOLI есть только один домен:
Идентификатор Pfam — PF02580
Cокращенное название — Tyr_Deacylase
Полное название — D-тирозил-т-РНК-D-тирозил-деацилаза
Положение домена в последовательности — 28-145 а.о.
Изображение положения домена в 3D-структуре белка DTD_ECOLI
Идентификатор PDB — 1jke.
Описание семейства доменов, к которому относится N-концевой домен белка DTD_ECOLI
Семейство доменов, к которому относится домен белка DTD_ECOLI, составлено из нескольких D-тирозил-т-РНК-D-тирозил-деацилаз. Замедление клеточного роста некоторыми D-аминокислотами может быть объяснено сборкой молекул D-аминоацил-тРНК. Escherichia coli и дрожжи производят фермент D-тирозил-т-РНК-D-тирозил-деацилазу, способный преобразовывать такие молекулы в свободные т-РНК и D-аминокислоты. Соответственно, при дезактивации генов, отвечающих за вышеуказанные деацилазы, токсичность D-аминокислот возрастает. Ортологи деацилаз найдены во многих клетках.
Встречаемость белков с доменом PF02580 в различных таксонах
| Таксон | | Количество белков с доменом PF02580 |
| Эукариоты | Растения | 3 |
| Грибы | 8 |
| Животные | 11 |
| Бактерии | | 85 |
| Археи | | 0 |
Число известных белков с доменом PF02580 — 136
Чаще всего домен PF02580 является единственным в белке (только в 29-ти белках в структуру входят еще и домены "low complexity" ("низкой сложности"), плюс белок DTD1_HUMAN, состоящий, помимо домена PF02580, еще и из домена Pfam-B_129156)
Случаев дупликаци домена PF02580 не наблюдается
Домены "low complexity" могут располагаться как слева, так и справа от домена PF02580
©
Храмеева Екатерина, 2005