Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~Manon/Term_1/ligand.html
Дата изменения: Wed Dec 22 09:48:20 2004
Дата индексирования: Tue Oct 2 07:51:46 2012
Кодировка: Windows-1251
Ligand Первый семестр

Изображение области связывания ADV c ADPP_ECOLI

Область связывания была выделена с помощью программы RasMol и команды "within" которая отображает аминокислотные остатки, находящиеся на заданном расстоянии от лиганда.
AA1(Arg 79)— aминокислота наиболее активно участвующая в связывании белка ADPP_ECOLI и лиганда ADV.
AA2(GLU 112)— аминокислота наименее активно участвующая в связывании

Проект генно-инженерного эксперемента

1.Список аминокислотных остатков белка, контактирующих с молекулой ADV: Phe28, Phe29, Arg51, Glu52, Arg56, Arg79, Gly97,Met98, Glu112, Glu116, Pro134, Gly135, Glu139,Glu162, Glu164
2.Замена аминокислотного остататка-Arg79 может привести к потере способности связывания ADV и белка. Среди 20-ти основных аминокислот Аргинин, единственный аминокислотный остаток, который имеет радикал содержащий три атома азота. Вследствие этого замена его на похожее основание невозмозно. Аргинин образует 2-е водородные связи на малом расстоянии (2.9 А, 2.7А), что свидетельствует о его значимости в связывании белка и ADV
3. Glu112 Данный аминокислотный остаток соединяестя c ADV водородной связью на расстоянии 3,5 А. Замена его например на Глутамин может быть совсем незначительна. Глутамин и Глутаминовая кмслота являются гидрофильными аминокислотными остатками, что свидетельствует о возможности замены без значительных изменений во взаимодействии белка и ADV