|
На рисунке отображены домены, входящие в белок PFLB_ECOLI:
 |
|||
| Идентификатор Pfam | Cокращенное название | Полное название | Положение домена в последовательности |
| PF02901 | PFL | Пируват-форматлиаза | 9-613 а.о |
| PF01228 | Gly_radical | Глициновый радикал | 629-740 а.о |
|
Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес
оригинального документа
: http://kodomo.cmm.msu.ru/~Redwitch/t2_files/pfam.html
Дата изменения: Sat May 14 16:42:59 2005 Дата индексирования: Tue Oct 2 10:45:32 2012 Кодировка: Windows-1251 |
Действия:
с помощью поисковой системы Pfam были найдены доменная структура белка PFLB_ECOLI (P09373) и ее описание.
|
Так выглядит пируват формат лиаза в комплексе с пируватом и коэнзимом А. Структура белка PFLB_ECOLI.
|
||||||||||||||||
PFL: пируват формат лиаза (возможно другое название - формат С-ацетилтрансфераза) - это энзим, который преобразует ацетил коэнзим А и формат в коэнзим А и пируват.
Выполняется реакция: ацетил-CoA + формат= CoA + пируват.
Замечание: в организме кишечной палочки использует радикальный механизм, чтобы обратимо разорвать С1-С2 связь в молекуле пирувата, используя при этом остаток глицина 734 и два цистеиновых остатка.
Итак, домен PFL обладает формат С-ацетилферазной активностью, участвует в процессах глюкозного метаболизма и является одним из компонентов цитоплазмы.
Glycine radical: учитывая функции белка в клетках, нужно заметить, что после трансляции белок преобразуется при анаэробных условиях из неактивной формы в активную. Активная форма обязательно содержит стабильный радикал, который присоединяется к определенному остатку глицина. Таким образом, глициновый радикал выполняет каталитические функции ("активация" энзима) и участвет в процессах метаболизма.
|
Данный домен может быть как единственным (12 белков с данным типом архитектуры), так и в сочетании с другими доменами (128 белков с данными типами архитектуры). Известны случаи дупликации домена (1 белок), но в то же время перестановок доменов не наблюдается (домен PFL всегда стоит первым). | ||||||||||||||||