Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес
оригинального документа
: http://kodomo.cmm.msu.ru/~adelya/pfam.html
Дата изменения: Thu Oct 7 12:39:54 2004
Дата индексирования: Mon Oct 1 22:12:13 2012
Кодировка: Windows-1251
Доменная структура белка Elongation factor Ts из Ecoli.
База данных PFAM включает 7426 записей с краткой характеристикой разных семейств белковых доменов, включая их множественные выравнивания. Каждый домен в PFAM описан с помощью профиля-НММ.
Согласно базе данных PFAM в белке EFTS существует 2 домена.
Изображение доменной структуры EFTS_Ecoli:
Описание каждого домена по данным PFAM:
Зеленым цветом обозначен домен UBA
Его положение в последовательности: 3-43
Идентификатор записи в PFAM: PF00627
UBA домены содержатся в различных белках, вовлеченных в процесс вырезания и восстановления ДНК, и подающих сигнал через белковую киназу. Гидрофобная поверхность UBA доменов взаимодействует с гидрофобной частью бета-листа.
Красным цветом обозначен домен EF_TS
Положение в последовательности: 56-262
Идентификатор записи в PFAM: PF00889
В прокариотах фактор элонгации Ts является компонентом цикла элонгации биосинтеза белка. Взаимодействует с EF-Tu.
Наложение доменной структуры на пространственную структуру белка.
Красным цветом отмечен домен EF_TS , зеленым - UBA .