Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~alexa-sh/term1/text/secondary.html
Дата изменения: Mon Dec 21 11:33:33 2009
Дата индексирования: Tue Oct 2 18:49:49 2012
Кодировка: Windows-1251
Исследование вторичной структуры белка PCRB_BACSU (PDB ID 1VIS)

Исследование вторичной структуры белка PCRB_BACSU

α спиралей - 9
β тяжей - 8
β поворотов - 22
Белок α/β, поскольку α-спирали чередуются с β-тяжами
Для исследования выбраны следующие элементы вторичной структуры:
α-спираль 126 - 152 (состоит из 2х спиралей),
Пара соседних параллельных β-тяжей 113-120 и 78-84
Пара соседних антипараллельных β-тяжей(1bs2.ent) 109-114 и 101-106
β-поворот 14 - 17

Паттерн Н-связей: Н(i,i+4), где i принадлежит промежутку [126;148]
Атомы Сβ повернуты таким образом, что не заходят в область спирали


Это параллельные β-тяжи моего белка, относительно плоскости β-тяжа атомы Сβ расположены поочередно: вверх-вниз


Относительно плоскости β-тяжа атомы Сβ расположены идентично атомам в предыдущем β-листе

Выбранный Сβ-поворот — Asp14Pro15Asn16Lys17
Н-связей, способных "скрепить" поворот нет.