Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~alexa-sh/term6/text/6.html
Дата изменения: Thu Jun 7 18:18:13 2012
Дата индексирования: Tue Oct 2 16:44:28 2012
Кодировка: Windows-1251
Вычисление точечных зарядов и VdW параметров для молекулярной механики

Вычисление точечных зарядов и VdW параметров для молекулярной механики

Ссылка на Google

Ссылка на сайт kodomo

Файл et.top - описание молекулы в формате пакета программ GROMACS.
script

Жидкость Газ
Epsilon LJ(kJ/mol) Coulomb(kJ/mol) LJ(kJ/mol) Coulomb(kJ/mol)
1.00000 -241.252 0.104627 -0.000226489 0.00563674
0.12500 -33.4987 0.03734 -0.000157829 0.00563675
0.03703 -2.17679 0.0167636 -0.000141172 0.00563674
0.01562 -2.28293 0.0148439 -0.000134252 0.00563673
0.00800 -2.52502 0.0145191 -0.000130619 0.00563673
0.00462 -2.73929 0.0144559 -0.000128428 0.00563673
0.00291 -1.07137 0.0141016 -0.000126999 0.00563673

Как видно из полученных данных, вклад кулоновских сил мал по сравнению с Ван-дер-Ваальсовыми. Для газа значения энергий VdW взаимодействий все порядка 10-4, тогда как у жидкости минимальный порядок 1. Т.к. для обеих фаз кулоновские взаимодействия намного меньше, чем VdW, то для оценки энтальпии испарения можно использовать значения только для VdW взаимодействий в жидкой фазе. Чтобы воспроизводилась энтальпия испарения этана, epsilon водорода должна лежать в диапозоне от 0.01562 до 0.03703.

© Шерстюк Александра, MSU 2012