Шестой семестр

1. • Введение в PyMOL

2. • Cеми-эмпирические вычисления: Mopac

3. • Abinitio вычисления для нафталина и азулена

4. • Вычисление параметров для молекулярной механики

5. • Вычисление точечных зарядов и VdW параметров для молекулярной механики

6. • Изучение работы методов контроля температуры в GROMACS

7. • Молекулярная динамика биологических молекул в GROMACS и анализ результатов

8. • Гомологичное моделирование комплекса белка с лигандом

9. • Докинг низкомолекулярных лигандов в структуру белка