Контакт белка MURG_ECOLI с лигандом SO42- |
Проекты
Семестры:
[1 2 3 4 5 6 7 8 9 10]
Обо мне
|
Белок MURG_ECOLI: Главная страница Конакты с лигандом Аминоксилотный состав |
В структуре 1F0K был обнаружен лиганд SO42- (сульфат ион), контактирующий с белком. Были исследованы его взаимодействия с аминокислотными остатками белка и сделаны предположения о том, какие замены аминокислот как повлияют на сродство белка к лиганду
Влияние замены аминокислот
Сульфат ион в основном взаимодействует аминогруппами аргинина и с N полипептидной цепи. Боковые радикалы остальных аминокислот (?? 77-80) направлены наружу от иона, поэтому больше всего уменьшат сродство белка к лиганду замена Arg80 на аминокислоту с не-положительно заряжунным радикалом. Замена остальных аминокислот может уменьшить сродство, только если это будут отрицательно заряженные радикалы (например, кислоты Glu, Asp). Увеличат сродство белка, скорее всего, замены неполярных аминокислот на положительные, напрмер, содержащие в радикалах аминогруппы: Leu79 на Arg.
© 2006 Артем Артемов. artemov@kodomo.cmm.msu.ru