Грамм-отрицательная коккоидная бактерия:
облигатный внутриклеточный эндосимбионт
амеб Acanthamoeba spp. Метаболизм сопряжен
с обменом веществ клеток хозяина. Имеет множество признаков типичных для хламидий как,
например, строение клеточной стенки. Присутствует уникальный двухфазный цикл развития, в ходе которого живут в амебах и членистоногих.
Таксономия:
бактерия
группа Хламидии, Chlamydiae/Verrucomicrobia group,
класс Хламидии,
порядок Хламидии,
семейство Parachlamydiaceae (парахламидии),
род Candidatus Protochlamydia,
вид Candidatus Protochlamydia amoebophila
штамм UWE25
Генотип протохламидии был секвенирован для проверки родства с хламидиями. По результатам анализов генома в порядке хламидии
было выделено отдельное семейство парахламидии. Детально изучались последовательности генов 16S, 23S rRNA, endoribonuclease
P RNA. Наряду с этим производился филогенетический анализ 44 рибосомных белков. Полученные данные при сравнении с изученными
геномами хламидий позволили по-новому взглянуть на их эволюцию и изучить их адаптации к разным эукариотическим хозяевам.
Статья из базы данных Pub Med:
Int J Syst Evol Microbiol. 2005 Sep;55(Pt 5):1863-6.
'Candidatus Protochlamydia amoebophila', an endosymbiont of Acanthamoeba spp.
Collingro A, Toenshoff ER, Taylor MW, Fritsche TR, Wagner M, Horn M.
Department of Microbial Ecology, University of Vienna, 1090 Vienna, Austria.
Abstract
The obligately intracellular coccoid bacterium UWE25, a symbiont of Acanthamoeba spp.,
was previously identified as being related to chlamydiae based upon the presence of a
chlamydia-like developmental cycle and its 16S rRNA gene sequence. Analysis of its complete
genome sequence demonstrated that UWE25 shows many characteristic features of chlamydiae,
including dependency on host-derived metabolites, composition of the cell envelope and the
ability to thrive as an energy parasite within the cells of its eukaryotic host. Phylogenetic
analysis of 44 ribosomal proteins further confirmed the affiliation of UWE25 to the 'Chlamydiae'.
Within this phylum, UWE25 could be assigned to the family Parachlamydiaceae based on comparative
analyses of the 16S rRNA, 23S rRNA and endoribonuclease P RNA genes. The distinct dissimilarities from
its closest relative, Parachlamydia acanthamoebae Bn(9)(T) (7.1, 9.7 and 28.8%, respectively), observed in this
analysis justify its classification in a new genus. Therefore, the name 'Candidatus Protochlamydia amoebophila'
is proposed for the designation of the Acanthamoeba sp. symbiont UWE25 (=ATCC PRA-7).
PMID: 16166679 [PubMed - indexed for MEDLINE]Free Article
Запрос: protochlamydia amoebophila ''complete genome'' 18 статей