Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~d04shagam/t3_files/credit2/prot6.doc Дата изменения: Mon Nov 7 20:13:55 2005 Дата индексирования: Sat Dec 22 07:02:03 2007 Кодировка: koi8-r

Информация банка EMBL о гене белка SODF_ECOLI
Задания
1) Найти ссылки на банк EMBL в документе SwissProt, относящемся к моему
белку, заполнить таблицу для 2 ссылок.
2) Извлечь из двух записей EMBL последовательности, кодирующие мой белок,
в виде отдельных файлов. Сравнить их. Указать в отчете процент различий.
Результаты
Из документа Swissprot, где описан белок SODF_ECOLI, извлечена
информация о записях EMBL генов, его кодирующих. В таблице приведены 2 из
них.
Работа проводилась с использованием программы entret (извлечение записей)
пакета EMBOSS

| | Запись EMBL #1 | Запись EMBL #2 |
|ID | ECSODB | ECD809 |
|AC | J03511 | D90809 |
|Тип молекулы (ДНК/РНК) | ДНК генома | ДНК генома |
|Длина посл-ти в записи | 970 пар нуклеотидов | 18451 пар нуклеотидов |
|Раздел банка | PRO | PRO |
|Начало гена в записи | 177 | 6970 |
|Конец гена в записи | 758 | 7551 |
|Направление гена | Прямое | прямое |
|Дата последнего | 4 марта 2000г. | 17 апреля 2005г. |
|изменения документа | | |
|Примечания |Супероксид дисмутаза |Похож на [PIR Accession|
| |(sodB) |Number A29940] |

Последовательности, описанные в ECSODB и ECD809 в качестве кодирующих
SODF_ECOLI, совпадают на 100%. Их выравнивание сделано программой needle,
последовательности извлекались при помощи программы seqret - всё того же
пакета EMBOSS.