Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~desislava/rasmol5.html
Дата изменения: Mon Dec 17 00:53:04 2007
Дата индексирования: Tue Oct 2 01:41:06 2012
Кодировка: Windows-1251
Бета тяжи 3 и 8 На главную
Первый семестр

Анализ взаимного расположения двух бета-тяжей.


Анализируются следующие тяжи:

3- образован атомами остатков 130-135 цепи b,
8- остатков 186-197 цепи b.

Для данной пары тяжей подсчитаны следующие величины:

  • Среднее значение торсионных углов: phi -77.5; psi 98.
  • Максимальное значение углов: phi 177,7; psi 178,9.
  • Минимальное значение: phi -145.4; psi -176.2.
    • Водородные связи образуются между -NH следующих атомов N и следующими атомами О:
    leu130:b.n --- ile196:b.o
    ile196:b.n --- leu130:b.o

    ala132:b.n --- gly194:b.o
    gly194:b.n --- ala132:b.o
    val193:b.n --- ala132:b.o

    his134:b.n --- leu191:b.o
    leu191:b.n --- his134:b.o

    lys135:b.n --- val133:b.o

    glu189:b.n --- thr187:b.o

    Взаимодействие тяжей с другими атомами белка:


    

    
Имя атома остатка тяжаИмя контактируещего атомаРасстояние в АПредположительная природа контакта
    

     
leu130b.o 
    leu130b.cd 
     leu131b.n 
     leu130b.cd    		
ile196b.n
     ile196.cg
     leu113b.o 
     tyr98b.cz    		
2.9
     4.6
     2.8
     4.1    		
Водородная связь
     Гидрофобное взаимодействие
     Водородная связь 
     Гидрофобное взаимодействие

    ©Десислава Митева, 2007