Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~golikov_v/md/dppc.itp Дата изменения: Fri May 27 10:20:22 2011 Дата индексирования: Tue Oct 2 06:55:45 2012 Кодировка:

[ moleculetype ]
; Name nrexcl
DPPC 3

[ atoms ]
; nr type resnr residu atom cgnr charge mass
1 LC3 1 DPPC C1 0 0.4000 15.0350 ; qtot:0.36
2 LC3 1 DPPC C2 0 0.4000 15.0350 ; qtot:0.72
3 LC3 1 DPPC C3 0 0.4000 15.0350 ; qtot:1.08
4 LNL 1 DPPC N4 0 -0.5000 14.0067 ; qtot:0.76
5 LH2 1 DPPC C5 0 0.3000 14.0270 ; qtot:1.0
6 LC2 1 DPPC C6 1 0.4000 14.0270 ; qtot:1.0
7 LOS 1 DPPC O7 1 -0.800 15.9994 ; qtot:0.54
8 LP 1 DPPC P8 1 1.700 30.9738 ; qtot:2.3
9 LOM 1 DPPC O9 1 -0.800 15.9994 ; qtot:1.5
10 LOM 1 DPPC O10 1 -0.800 15.9994 ; qtot:0.7
11 LOS 1 DPPC O11 1 -0.700 15.9994 ; qtot:0
12 LC2 1 DPPC C12 2 0.400 14.0270 ; qtot:0.08
13 LH1 1 DPPC C13 2 0.300 13.0190 ; qtot:0.52
14 LOS 1 DPPC O14 2 -0.700 15.9994 ; qtot:-0.14
15 LC 1 DPPC C15 2 0.7000 12.0110 ; qtot:0.56
16 LO 1 DPPC O16 2 -0.700 15.9994 ; qtot:0.0
17 LP2 1 DPPC C17 3 0.0 14.0270 ; qtot:
18 LP2 1 DPPC C18 4 0 14.0270 ; qtot:
19 LP2 1 DPPC C19 5 0 14.0270 ; qtot:
20 LP2 1 DPPC C20 6 0 14.0270 ; qtot:
21 LP2 1 DPPC C21 7 0 14.0270 ; qtot:
22 LP2 1 DPPC C22 8 0 14.0270 ; qtot:
23 LP2 1 DPPC C23 9 0 14.0270 ; qtot:
24 LP2 1 DPPC C24 10 0 14.0270 ; qtot:
25 LP2 1 DPPC C25 11 0 14.0270 ; qtot:
26 LP2 1 DPPC C26 12 0 14.0270 ; qtot:
27 LP2 1 DPPC C27 13 0 14.0270 ; qtot:
28 LP2 1 DPPC C28 14 0 14.0270 ; qtot:
29 LP2 1 DPPC C29 15 0 14.0270 ; qtot:
30 LP2 1 DPPC C30 16 0 14.0270 ; qtot:
31 LP3 1 DPPC C31 17 0 15.0350 ; qtot:
32 LC2 1 DPPC C32 18 0.50 14.0270 ; qtot:
33 LOS 1 DPPC O33 18 -0.70 15.9994 ; qtot:
34 LC 1 DPPC C34 18 0.800 12.0110 ; qtot:
35 LO 1 DPPC O35 18 -0.60 15.9994 ; qtot:
36 LP2 1 DPPC C36 19 0 14.0270 ; qtot:
37 LP2 1 DPPC C37 20 0 14.0270 ; qtot:
38 LP2 1 DPPC C38 21 0 14.0270 ; qtot:
39 LP2 1 DPPC C39 22 0 14.0270 ; qtot:
40 LP2 1 DPPC C40 23 0 14.0270 ; qtot:
41 LP2 1 DPPC C41 24 0 14.0270 ; qtot:
42 LP2 1 DPPC C42 25 0 14.0270 ; qtot:
43 LP2 1 DPPC C43 26 0 14.0270 ; qtot:
44 LP2 1 DPPC C44 27 0 14.0270 ; qtot:
45 LP2 1 DPPC C45 28 0 14.0270 ; qtot:
46 LP2 1 DPPC C46 29 0 14.0270 ; qtot:
47 LP2 1 DPPC C47 30 0 14.0270 ; qtot:
48 LP2 1 DPPC C48 31 0 14.0270 ; qtot:
49 LP2 1 DPPC C49 32 0 14.0270 ; qtot:
50 LP3 1 DPPC C50 33 0 15.0350 ; qtot:

[ bonds ]
; ai aj funct
4 5 1 0.14700E+00 0.37660E+06
5 6 1 0.15300E+00 0.33470E+06
6 7 1 0.14300E+00 0.25100E+06
7 8 1 0.16100E+00 0.25100E+06
8 9 1 0.14800E+00 0.37660E+06
8 10 1 0.14800E+00 0.37660E+06
8 11 1 0.16100E+00 0.25100E+06
11 12 1 0.14300E+00 0.25100E+06
12 13 1 0.15300E+00 0.33470E+06
13 14 1 0.14350E+00 0.25100E+06
13 32 1 0.15300E+00 0.33470E+06
14 15 1 0.13600E+00 0.37660E+06
15 16 1 0.12300E+00 0.50210E+06
15 17 1 0.15300E+00 0.33470E+06
17 18 1 0.15300E+00 0.33470E+06
18 19 1 0.15300E+00 0.33470E+06
19 20 1 0.15300E+00 0.33470E+06
20 21 1 0.15300E+00 0.33470E+06
21 22 1 0.15300E+00 0.33470E+06
22 23 1 0.15300E+00 0.33470E+06
23 24 1 0.15300E+00 0.33470E+06
24 25 1 0.15300E+00 0.33470E+06
25 26 1 0.15300E+00 0.33470E+06
26 27 1 0.15300E+00 0.33470E+06
27 28 1 0.15300E+00 0.33470E+06
28 29 1 0.15300E+00 0.33470E+06
29 30 1 0.15300E+00 0.33470E+06
30 31 1 0.15300E+00 0.33470E+06
32 33 1 0.14300E+00 0.25100E+06
33 34 1 0.13600E+00 0.37660E+06
34 35 1 0.12300E+00 0.50210E+06
34 36 1 0.15300E+00 0.33470E+06
36 37 1 0.15300E+00 0.33470E+06
37 38 1 0.15300E+00 0.33470E+06
38 39 1 0.15300E+00 0.33470E+06
39 40 1 0.15300E+00 0.33470E+06
40 41 1 0.15300E+00 0.33470E+06
41 42 1 0.15300E+00 0.33470E+06
42 43 1 0.15300E+00 0.33470E+06
43 44 1 0.15300E+00 0.33470E+06
44 45 1 0.15300E+00 0.33470E+06
45 46 1 0.15300E+00 0.33470E+06
46 47 1 0.15300E+00 0.33470E+06
47 48 1 0.15300E+00 0.33470E+06
48 49 1 0.15300E+00 0.33470E+06
49 50 1 0.15300E+00 0.33470E+06
1 4 1 0.14700E+00 0.37450E+06
2 4 1 0.14700E+00 0.37450E+06
3 4 1 0.14700E+00 0.37450E+06

[ pairs ]
; ai aj funct
1 6 1
2 6 1
3 6 1
4 7 1
5 8 1
6 9 1
6 10 1
6 11 1
7 12 1
8 13 1
9 12 1
10 12 1
11 14 1
11 32 1
12 15 1
12 33 1
13 16 1
13 17 1
13 34 1
14 18 1
14 33 1
15 19 1
15 32 1
16 18 1
32 35 1
32 36 1
33 37 1
34 38 1
35 37 1

[ angles ]
; ai aj ak funct
4 5 6 1 0.10950E+03 0.46020E+03
5 6 7 1 0.10950E+03 0.46020E+03
6 7 8 1 0.12000E+03 0.39750E+03
7 8 9 1 0.10960E+03 0.39750E+03
7 8 10 1 0.10960E+03 0.39750E+03
7 8 11 1 0.10300E+03 0.39750E+03
8 11 12 1 0.12000E+03 0.39750E+03
9 8 10 1 0.12000E+03 0.58580E+03
9 8 11 1 0.10960E+03 0.39750E+03
10 8 11 1 0.10960E+03 0.39750E+03
11 12 13 1 0.11100E+03 0.46020E+03
12 13 14 1 0.10950E+03 0.46020E+03
12 13 32 1 0.10950E+03 0.46020E+03
13 14 15 1 0.12000E+03 0.41840E+03
13 32 33 1 0.11100E+03 0.46020E+03
14 13 32 1 0.10950E+03 0.46020E+03
14 15 16 1 0.12400E+03 0.50210E+03
14 15 17 1 0.11500E+03 0.50210E+03
15 17 18 1 0.11100E+03 0.46020E+03
16 15 17 1 0.12100E+03 0.50210E+03
17 18 19 1 0.11100E+03 0.46020E+03
18 19 20 1 0.11100E+03 0.46020E+03
19 20 21 1 0.11100E+03 0.46020E+03
20 21 22 1 0.11100E+03 0.46020E+03
21 22 23 1 0.11100E+03 0.46020E+03
22 23 24 1 0.11100E+03 0.46020E+03
23 24 25 1 0.11100E+03 0.46020E+03
24 25 26 1 0.11100E+03 0.46020E+03
25 26 27 1 0.11100E+03 0.46020E+03
26 27 28 1 0.11100E+03 0.46020E+03
27 28 29 1 0.11100E+03 0.46020E+03
28 29 30 1 0.11100E+03 0.46020E+03
29 30 31 1 0.11100E+03 0.46020E+03
32 33 34 1 0.12000E+03 0.41840E+03
33 34 35 1 0.12400E+03 0.50210E+03
33 34 36 1 0.11500E+03 0.50210E+03
34 36 37 1 0.11100E+03 0.46020E+03
35 34 36 1 0.12100E+03 0.50210E+03
36 37 38 1 0.11100E+03 0.46020E+03
37 38 39 1 0.11100E+03 0.46020E+03
38 39 40 1 0.11100E+03 0.46020E+03
39 40 41 1 0.11100E+03 0.46020E+03
40 41 42 1 0.11100E+03 0.46020E+03
41 42 43 1 0.11100E+03 0.46020E+03
42 43 44 1 0.11100E+03 0.46020E+03
43 44 45 1 0.11100E+03 0.46020E+03
44 45 46 1 0.11100E+03 0.46020E+03
45 46 47 1 0.11100E+03 0.46020E+03
46 47 48 1 0.11100E+03 0.46020E+03
47 48 49 1 0.11100E+03 0.46020E+03
48 49 50 1 0.11100E+03 0.46020E+03
1 4 2 1 0.10950E+03 0.33470E+03
2 4 3 1 0.10950E+03 0.33470E+03
3 4 1 1 0.10950E+03 0.33470E+03
1 4 5 1 0.10950E+03 0.37660E+03
2 4 5 1 0.10950E+03 0.37660E+03
3 4 5 1 0.10950E+03 0.37660E+03

[ dihedrals ]
; ai aj ak al funct phi0 cp mult
1 4 5 6 1 0.0 3.76 3
4 5 6 7 1 0.0 5.85 3
5 6 7 8 1 0.0 3.76 3
6 7 8 11 1 0.0 1.05 3
6 7 8 11 1 0.0 3.14 2
7 8 11 12 1 0.0 1.05 3
7 8 11 12 1 0.0 3.14 2
8 11 12 13 1 0.0 3.76 3
11 12 13 14 1 0.0 2.09 2
11 12 13 32 1 0.0 5.85 3
11 12 13 32 1 0.0 0.42 2
12 13 32 33 1 0.0 5.85 3
12 13 32 33 1 0.0 0.42 2
12 13 14 15 1 0.0 3.77 3
13 32 33 34 1 0.0 3.76 3
13 14 15 17 1 180.0 16.74 2
14 13 32 33 1 0.0 2.09 2
14 15 17 18 1 0.0 0.42 6
15 17 18 19 1 0.0 5.86 3
17 18 19 20 3
18 19 20 21 3
19 20 21 22 3
20 21 22 23 3
21 22 23 24 3
22 23 24 25 3
23 24 25 26 3
24 25 26 27 3
25 26 27 28 3
26 27 28 29 3
27 28 29 30 3
28 29 30 31 3
13 32 33 34 1 0.0 3.76 3
32 33 34 36 1 180.0 16.74 2
33 34 36 37 1 0.0 0.42 6
34 36 37 38 1 0.0 5.86 3
36 37 38 39 3
37 38 39 40 3
38 39 40 41 3
39 40 41 42 3
40 41 42 43 3
41 42 43 44 3
42 43 44 45 3
43 44 45 46 3
44 45 46 47 3
45 46 47 48 3
46 47 48 49 3
47 48 49 50 3

[ dihedrals ]
; ai aj ak al funct
13 14 32 12 2 35.264 0.33470E+03
15 14 17 16 2 0.00000E+00 0.16740E+03
34 33 36 35 2 0.00000E+00 0.16740E+03

#ifdef POSRES_LIPID
#include "lipid_posre.itp"
#endif