Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~ipoverennaya/term5/elektron.html
Дата изменения: Sun Oct 24 13:45:42 2010
Дата индексирования: Tue Oct 2 14:05:51 2012
Кодировка: Windows-1251
Электронная плотность

Занятие 3. Электронная плотность.

  1.  В записи 2B5A глутамин 21 цепи C имеет две альтернативных кон формации, такие же глутамины трех других цепей – по одной конформации. Файл с электронной плотностью для данной записи: 2b5a.omap. В программе PyMol было получено изображение глутамина 21 цепи С с обеими конформациями и наложенными поверхностями уровней 0.5 и 1.0 электронной плотности в окрестности остатка:

    Изображение глутамина 21 цепи С с обеими конформациями и поверхностью уровня 0.5 электронной плотности.
    Изображение глутамина 21 цепи С с обеими конформациями и поверхностью уровня 1.0 электронной плотности.
    Желтым обозначена поверхность электронной плотности уровня 1.0, а белым - уровня 0.5.
    Из рисунка видно, что вокруг связи CG-CD низкая электронная плотность, особенно в конформации B (на рисунке слева-вверху).
    Аналогичные изображения были созданы для глутамина 21 цепи B:
    Изображение глутамина 21 цепи B с поверхностью уровня 0.5 электронной плотности.
    Изображение глутамина 21 цепи B поверхностью уровня 1.0 электронной плотности.
  2. С сайта http://eds.bmc.uu.se/eds/ был получен файл с электронной плотностью для записи 1KNP. Была рассмотрен аргинин 465 цепи А. Изображение данного остатка с его электронной плотностью:

    Желтым обозначена поверхность электронной плотности уровня 1.0, а белым - уровня 0.5.
Меню
· Главная
· Результаты исследований
· Семестры
· Полезные ссылки
 · Контакты
© Ирина Поверенная, 2008