Этот семестр дал нам много новых важных знаний и навыков. Фактически нам был предложен набор ориентиров в мире биоинформатики, которые позволяют не заблудиться с первых шагов. Достаточно того, что у нас сложилось представление о том, что необходимо предпринять, если в распоряжении нет ничего, кроме последовательности белка или его ID в какой-нибудь базе данных, и предстоит работа с этим белком или с целым семейством.

Кроме того, мы познакомились с принципами алгоритмов выравниваний, построения филогенетических деревьев, матриц аминокислотных замен, поиска последовательностей "по гомологии" и вообще узнали, что все это такое. Теперь нам есть, на что опереться, приступая к решению новых задач.

1. Поиск в банках аминокислотных последовательностей белков с теми же функциями, что и у рибосомного белка L25 E.coli
   
2. Алгоритмы попарного выравнивания
   
3. BLASTP - инструмент поиска последовательностей в банках данных по гомологии
   
4. Описание общей доменной структуры рибосомного белка L25 E.coli и известных мотивов в его аминокислотной последовательности
5. Деревья


Дополнительно:


6. PSI-BLAST - принципы работы и сравнение с BLASTP
   
7. Курсовая работа