Состав записи 1O8B банка PDB
Компоненты структуры, описанной в документе PDB 1O8B
Заголовок структуры: ISOMERASE 26-NOV-02 1O8B
Название структуры: STRUCTURE OF ESCHERICHIA COLI RIBOSE-5-PHOSPHATE ISOMERASE, RPIA, COMPLEXED WITH ARABINOSE-5-PHOSPHATE.
В документе представлены следующие цепи макромолекул:
Идентификатор цепи |
Число остатков |
Название молекулы |
Комментарии |
| A | 168 | RIBOSE-5-PHOSPHATE ISOMERASE | есть только остатки: 23-31,47-55,68-97,99-218; всего в белке 219 а.о. |
| B | 212 | RIBOSE-5-PHOSPHATE ISOMERASE | есть только остатки: 2-17,22-97,99-218; всего в белке 219 а.о. |
В документе представлены следующие низкомолекулярные вещества:
ID |
Название |
Формула |
Число копий |
Комментарии |
| MSE | SELENOMETHIONINE | C5 H11 N1 O2 SE1 | 11 | 5 в цепи A и 6 в цепи B |
| ABF | BETA-D-ARABINOFURANOSE-5'-PHOSPHATE | C5 H11 O8 P1 | 2 | цепи E и F |
| HOH | water | H2 O1 | 159 | цепь Z |
изображение цепи B
изображение цепи B в остовной модели - желтый цвет. Кроме белка изображен лиганд.
характеристика вторичной структуры цепи B
Альфа спирали (всего 7):2-17, 29-41, 54-63, 69-73, 100-109, 139-150, 179-188.
Бета листы (3):
A состоит из тяжей(7)
66-68, 48-52, 23-26, 76-81, 112-116, 205-210, 212-217.
B состоит из тяжей(3+1)
121-123, 85-86(цепь А), 90-93, 196-198.
С состоит из тяжей(4)
153-156, 167-172, 131-135, 192-195.
изображение вторичной структуры:
Белок относится к белкам, имеющим альфа-спирали и бета-листы.