|
Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес
оригинального документа
: http://kodomo.cmm.msu.ru/~jimsonweed89/embl.html
Дата изменения: Tue Mar 3 15:53:13 2009 Дата индексирования: Tue Oct 2 01:47:06 2012 Кодировка: Windows-1251 |
|
|
|
|
|
Релиз содержит 99848570 записей, дата последней индексации - 21 января 2009.
| Обозначение | Oписание | Kоличество |
| ANN | Constructed sequence with annotation | nothing |
| CON | Constructed sequence | nothing |
| EST | Expressed Sequence Tag | 59604001 |
| GRV | Genome Reviews | nothing |
| GSS | Genome Survey Sequence | 24670960 |
| HTC | High Throughput cDNA sequencing | 531582 |
| HTG | High Throughput Genome sequencing | 139369 |
| MGA | Mass Genome Annotation | nothing |
| PAT | Patent | 7324419 |
| SET | Project set (EMBL WGS Masters only) | nothing |
| STD | Standard | 6263421 |
| STS | Sequence Tagged Site | 1305218 |
| TPA | Third Party Annotation | 6119 |
| TSA | Transcriptome Shotgun Assembly | 3481 |
| WGS | Whole Genome Shotgun | nothing |
| Обозначение | Oписание | Описание | Кол-во |
| ENV | Environmental Samples | Образцы окружающей среды | 3735223 |
| FUN | Fungi | Грибы | 3231825 |
| HUM | Human | Человек | 11807708 |
| INV | Invertebrates | Беспозвоночные | 14294051 |
| MAM | Other Mammals | Другие млекопитающие | 8686059 |
| MUS | Mus musculus | Геном мыши | 7330487 |
| PHG | Bacteriophage | Бактериофаг | 4896 |
| PLN | Plants | Растения | 28334269 |
| PRO | Prokaryotes | Прокариоты | 675972 |
| ROD | Rodents | Грызуны | 1804253 |
| SYN | Synthetic | Синтезированный | 1500620 |
| TGN | Transgenic | Трансгенный | 265445 |
| UNC | Unclassified | Не относящийся ни к кому | 2956530 |
| VRL | Viruses | Вирусы | 624900 |
| VRT | Other Vertebrates | Другие позвоночные | 9288565 |
Ген APOM
| Форма записи - обратная |
| Кодирующих участков 6 |
| Длина кодирующих участков: 114, 155, 74, 99, 99, 26 |
| Длины интронов: 391, 598, 753, 146, 340 |
|
Самый длинный экзон, вырезанный с помощью программы seqret exo2.fasta. |
| Для поиска белка, соответствующего экзону необходимо: |
| 1) Зайти на сайт Blast. |
| 2) Выбрать программу blastx |
| 3) Загрузить полученный выше файл в поле upload file |
| 4) Выбрать Базу данных SwissProt |
| 5) Нажать кнопку Blast |
|
Искомая последовательность судя по всему имеет идентификатор O95445.2. Это часть человеческого белка совпадающего с нашей нуклеотидной последовательностью на 100%. Рассмотренный экзон кодирует участок с 39 по 89 аминокислоты. |
Идетификаторы EMBL в SwissProt записи белка SUCC_Ecoli
| Идентификатор записи EMBL | Тип молекулы | Класс данных | Раздел EMBL | Дата создания документа |
Описание | Длина последовательности |
| U00096 | genomic DNA | STD | PRO | 23-FEB-2006 | Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655, complete genome. | 4639675 |
| J01619; | genomic DNA | STD | PRO | 25-FEB-1991 | Eschericia coli gltA gene, sdhCDAB operon and sucABCD operons, complete sequence. | 13063 |
| AP009048 | genomic DNA | STD | PRO | 22-JAN-2006 | Escherichia coli str. K12 substr. W3110 DNA, complete genome. | 16351 |