Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес
оригинального документа
: http://kodomo.cmm.msu.ru/~julia_p/model1.html
Дата изменения: Mon Apr 25 20:59:41 2011 Дата индексирования: Tue Oct 2 00:33:39 2012 Кодировка: Windows-1251 |
Для того, чтобы оценить зону контакта, посмотрим какие остатки находятся рядом с лигантом и какова поверхность контакта с ними:
Список остатков: GLU 35 ASN 46 ASP 52 GLN 57 ASN 59 TYR 62 TRP 63 ASP 101 ASN 103 ALA 107 TRP 108 VAL 109 |
|
Проведем мутацию по триптофану 63 - заменим его на аланин:
Обратим внимание на указания в object motions на pymolwiki.
Для изменения формы используем режим Builder и изменяем торсионные углы. Ctrl+RightClick выбор связи, Ctrl+LeftClick вращение.
Сердечко наше храниться в файле.