Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~kathrine/doc/my_results27.doc Дата изменения: Mon May 24 16:52:36 2004 Дата индексирования: Tue Oct 2 12:06:59 2012 Кодировка: koi8-r

Деревья
Попарные значения процента идентичности
| |P11056 |O68926 |P22759 |O50172 |O50171 |
|P11056 |100% |93.7% |81.0% |72.5% |62.0% |
|O68926 |93.7% |100% |81.0% |73.8% |60.2% |
|P22759 |81.0% |81.0% |100% |74.4% |62.9% |
|O50172 |72.5% |73.8% |74.4% |100% |59.8% |
|O50171 |62.0% |60.2% |62.9% |59.8% |100% |


Наивная матрица эволюционных расстояний
| |P11056 |O68926 |P22759 |O50172 |O50171 |
|P11056 |0 |6.3% |19.0% |27.5% |38.0% |
|O68926 |6.3% |0 |19.0% |26.2% |39.8% |
|P22759 |19.0% |19.0% |0 |25.6% |37.1% |
|O50172 |27.5% |26.2% |25.6% |0 |40.2% |
|O50171 |38.0% |39.8% |37.1% |40.2% |0 |


Алгоритм:
Наивная матрица эволюционных замен была построена путем: 100% - identity
(взяты из матрицы попарных значений процента идентичности)
1. Neighbor-joining method (правило ближайших соседей), правильная
скобочная структура:
(O50172:14.21250,O50171:25.98750,((P11056:3.06667,O68926:3.23333):7.11250,
P22759:8.73750):2.51250);
2. UPGMA method(попарной невзвешенной кластеризации с арифметическим
усреднением), правильная скобочная структура:
((((P11056:3.15000,O68926:3.15000):6.35000,P22759:9.50000):3.71667,
O50172:13.21667):6.17083,O50171:19.38750);

|[pic] |[pic] |
|Дерево по алгоритму NJ |Дерево по алгоритму UPGMA |
|От самого древнего общего предка |От единого древнего предка |
|отошли три ветви, двумя из которых |отделились две ветви, одной из |
|являются белки O50171, O50172, а |которых является белок O50171, а |
|третья ветвь является предком еще |другая является предком еще четырех|
|для трех белков, причем белки P11056|белков, на этой ветви имеется |
|и O68926 имеют общего предка на этой|предок O50172 и оставшихся трех |
|ветви, а последний белок отходит |белков, на которой «висит» предок |
|ранее. |P22759 и пары белков (P11056 и |
| |O68926), имеющих общего предка на |
| |этой ветви. |