Описание бактерии Streptomyces coelicolor , ее протеома:

Рис1:Streptomyces coelicolor , Рис.2: и снова Streptomyces coelicolor

Среда обитания, условия обитания:

Повсеместно распространенные бактерии почвы,играют ключевую роль в глобальном

углеродистом цикле,разлагая нерастворимые остатки других организмов.Имеют большую

коллекцию ферментов,могут обработать множество питательных веществ.Достаточно

выносливы,чтобы пережить существенные изменения в температуре,воде и источниках

пищи.Более 12% генома вовлечены в облегчение биологических процессов,таких как ответ на

экологическую обстановку и напряжение(стресс).

Почему геном секвенирован:

Геном секвенирован,т.к.бактерия производит большинство естественных антибиотиков(включая тетрациклин и эритромицин),которые используются сегодня.Производит противораковые компоненты.Является новым инструментом для исследователей,пытающихся синтезировать фармацевтические препараты,используя генную инженерию бактерий.

Amino acid composition:

Рис: Геномная организация Streptomyces coelicolor состоит из 1 хромосомы и двух плазмид(SCP1 и SCP2). Данные взяты с сайта http://www.ebi.ac.uk/genomes/bacteria.html.

Исследования Streptomyces coelicolor:

Department of Cell and Organism Biology, Lund University, Lund, Sweden; Department of Cell and

- Molecular Biology, Uppsala University, Uppsala, Sweden; Departamento de Biolog?a Molecular, Area

- de Microbiolog?a, Facultad de Biolog?a, Universidad de Le?n, Le?n, Spain.

- Time-lapse imaging of Streptomyces hyphae revealed foci of the essential protein DivIVA at sites

- where lateral branches will emerge. Overexpression experiments showed that DivIVA foci can trigger

Геном и протеом ()

Статистические данные о геноме Streptomyces coelicolor:

Хромосома или плазмида	Protein count	Тип	Length (bp)	Av. CDS Length	GC content	CDS coverage	Gene count
Хромосома/td>	7768	линейная	8667507	989.385	72.1%	89%	7768
Плазмида SCP1	351	линейная	356023	811.056	69.1%	81%	350
Плазмида SCP2	34	кольцевая	31317	642.265	72.1%	70%	34
	8038

Рис1: Protein number per component, Рис.2: Protein length distribution, Рис.3: Triplet usage