Образование водородных связей между бета-тяжами в белке вторичной структуры происходит отнюдь не хаотичным образом. Существует закономерность образования водородных связей между атомами карбоксильных групп одной цепи и атомами амидных групп другой цепи. Из рисунка следует,что эти связи образовались между карбоксильными атомами ? 58,60,62 и соответствующими амидными атомами ? 75,73,71 что свидетельствует об антипаралллельности цепей.Этот характер связи между бета-тяжами подчинен правилу "паттерна".
Происходит связь:
N73 (val)---O60 (glu) ; N60 (glu)---O73 (val).
N62 (lys)---O71 (tyr) ; N71 (tyr)---O62 (lys).
Для получения данного изображения следует выполнить следующие команды:
restrict 54-81:A
backbone 90
select (oxygen,nitrogen,carbon)
cpk 100
color cpk
hbond
label val81,lys76,val77...
color label yellow
©Терешкова Алеся,2008