В структуре 1lmp.pdb проведем мутацию остатка 101 аспарагиновой кислоты, который расположен в пределах 5 ангстрем от лиганда - NAG (130 остаток) и, вероятно, ответственен за связывание с лигандом.

Заменим его на глицин средствами Tcl/Tk интерфейса (Wizard->Mutagenesis) - 1lmp_mut.pdb:

Сделаем ролик, в котором происходит совмещение белков и показывается место мутации - rolik.pml. Для его работы необходимо наличие файлов 1lmp.pdb и 1lmp_mut.pdb.

Создадим поли-аланиновую последовательность в форме валентинки. Для изменения формы будем использовать режим Editing и менять торсионные углы в режиме Builder (Ctrl+RightClick - выбор связи, Ctrl+LeftClick - вращение).

Рисунок является модернистским, поэтому сердце имеет явно раздувшееся правое предсердие.