Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~mashik/t3_html/evol_mod.html
Дата изменения: Tue Dec 6 19:38:53 2005
Дата индексирования: Tue Oct 2 11:33:31 2012
Кодировка: Windows-1251

evol_mod На главную страницу третьего семестра

Эволюционная модель

По формуле (((А:50,В:50):10,((С:23,D:23):17,Е:40):30):30,F:100)
c помощью автофигур редактора Word было создано дерево.
Расстояния указаны как число мутаций на 100 п.н.

Корень данного дерева — ген белка DEF_ECOLI. Длина гена — 510 нуклеотидных остатков.

Отчет по практическому заданию ? 11 (все задания)

Скрипт, получающий мутантные последовательности, соответствующие всем узлам и листьям данного дерева:

msbar def_gene.fasta mut_F.fasta -point 4 -count 510 -auto
msbar def_gene.fasta mut_1.fasta -point 4 -count 153 -auto
msbar mut_1.fasta mut_3.fasta -point 4 -count 153 -auto
msbar mut_1.fasta mut_2.fasta -point 4 -count 51 -auto
msbar mut_2.fasta mut_A.fasta -point 4 -count 255 -auto
msbar mut_2.fasta mut_B.fasta -point 4 -count 255 -auto
msbar mut_3.fasta mut_4.fasta -point 4 -count 87 -auto
msbar mut_3.fasta mut_E.fasta -point 4 -count 204 -auto
msbar mut_4.fasta mut_C.fasta -point 4 -count 117 -auto
msbar mut_4.fasta mut_D.fasta -point 4 -count 117 -auto