Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~monika/Kapshivaya_cr3.doc Дата изменения: Fri Dec 29 17:27:49 2006 Дата индексирования: Tue Oct 2 03:48:07 2012 Кодировка: koi8-r

Анализ генома и протеома бактерии Mycoplasma genitalium, штамм G-37.

Капшивая Ирина, студентка 1 курса, группа П3


Введение.

Русское название: половой микроорганизм (мое предположение)
Латинское название: Mycoplasma genitalium, штамм G37

Таксономия:
. Царство Bacteria
. Тип Firmicutes
. Отряд Mollicutes
. Семейство Mycoplasmataceae
. Род Mycoplasma
. Вид Mycoplasma genitalium
. Штамм G37

Mycoplasma genitalium, известный урогенитальный патоген человека, с позиции
количества генов носит звание самого экономного вида бактерий, способного
жить в чистой культуре. M. genitalium имеет всего 482 белок-кодирующих и 43
РНК-кодирующих гена с общим объемом генетической информации не более 580
kb. Заметим, что у человека предположительно 20-25 тысяч генов.

Ученые из Института Крега Вентера (Мэриленд, США) вот уже несколько лет
работают в области синтетической биологии и пытаются вырастить клетку с
минимальным количеством генов, достаточным для выживания в лабораторных
условиях. Неслучайно для этой цели ими была выбрана M. genitalium, а новый
подвид, в случае успеха получит название M. laboratorium.

В январском номере журнале PNAS группа синтетической биологии Вентера
опубликовала статью, в которой было показано гипотетически возможное
количество генов для выживания бактерии M. genitalium - 387 белок-
кодирующих и 43 РНК-кодирующих гена. К такому заключению исследователи
пришли после долгих лет работы с использованием метода транспозонового
мутагенеза. Отключая те или иные гены, ученые наблюдали за способностью
таких мутантов образовывать колонии. Оказалось, что мутации в любом РНК-
кодирующем гене приводили к гибели бактерий, а мутации в приблизительно 100
белок-кодирующих генах могли быть компенсированы работой остальных генов,
однако такие мутанты обладали ограниченными возможностями.

Таким образом, было показано, что геном M. genitalium одновременно с
чрезвычайной экономичностью обладает высокой пластичностью и способен к
выживанию в экстремальных условиях. Следующим этапом работы ученых будет
эксперимент по удалению около 100 генов M. genitalium и синтез M.
laboratorium. C другой стороны, ученые занимаются теоретическими вопросами
эволюции и пытаются выяснить, как могла появиться такая бактерия, если для
ее жизни уже изначально требовалось как минимум 430 функционирующих генов,
а более простых организмов, из которых бы могла M. genitalium
эволюционировать, не найдено.

Взято с сайта http://www.consilium-
medicum.com/media/consilium/05_01c/32.shtml
При электронной микроскопии было обнаружено, что M. genitalium имеет
колбообразную форму и суженную концевую часть, напоминающую наконечник. M.
genitalium имеет самую маленькую величину генома (600 т.п.н.) из всех
микоплазм и других самореплицирующихся микроорганизмов (для сравнения:
величина генома у M. pneumoniea - 800 т.п.н., C. trachomatis - 1450 т.п.н.,
E. coli - 4700 т.п.н.).

В последующие годы существовали определенные сложности в изучении этого
микроорганизма, связанные с трудностью получения его в чистой культуре
(рост на питательных средах составляет 1-5 мес). Высокая избирательность и
требовательность M. genitalium в отношении питательных сред объясняется
тем, что она имеет малый размер генома и как следствие малое количество
генов, принимающих участие в ферментном распаде питательных веществ,
необходимых для репликации микроорганизма (D.Taylor-Robinson, 1995).

Кроме того, M. genitalium имеет необходимую структуру генома для
совершения определенных активных скользящих движений, и это позволяет ей
внедряться в слои слизи, покрывающие эпителиальные клетки, а затем
прикрепляться и проникать в них. M. genitalium обладает способностью к
плотному прикреплению к эукариотическим клеткам посредством рецепторов,
содержащих нейраминовую кислоту, что обусловливает выраженное
цитопатогенное действие и формирование клеточного воспалительного ответа
(D.Taylor-Robinson, 1995).

Высокие адгезивные свойства M. genitalium подтверждались ее способностью
прикрепляться к поверхности не только эпителиальных клеток, но и даже
стекла и пластика. Установлено, что M. genitalium в отличие от своих
предшественников (M. hominis и U. urealyticum) практически никогда не
ассоциируется с бактериальным вагинозом и количеством половых партнеров
(D.Taylor-Robinson и соавт., 2002).

Новые возможности появились в 1991 г., когда для диагностики M.
genitalium был применен метод полимеразной цепной реакции (ПЦР), который до
сих пор остается наиболее доступным и единственным для исследователей и
практикующих врачей-венерологов (S.Jensen и соавт., 1991).

Микоплазма genitalium - грамм положительная бактерия.

Литература

1.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=genomeprj&cmd=Retrieve&d
opt=Overview&list_uids=13924
2. www.genoterra.ru/news/view/8/931 Здесь описывается о значимости
бактерии, что указано уже в отчете.
3. http://www.consilium-medicum.com/media/consilium/05_01c/32.shtml
4.
http://www.ebi.ac.uk/2can/genomes/genomes.html?http://www.ebi.ac.uk/2can/
genomes/bacteria/Mycoplasma_genitalium.html
5.
http://www.ebi.ac.uk/integr8/OrganismStatsAction.do;jsessionid=C00DD22A50
C627B4E086543094BBF1EF?orgProteomeId=31 геном бактерии.