Штамм Велгевонден (Университет Prestolia,Южная Африка)

• Линия происхождения: Протобактерия, Альфа-протобактерия
• Возбудители рода Реккетсиалез
• Cемейство : Анаплазматики
• Род : Ehrlichia (Эрхилия)
• Вид: ruminantium (Руминантиум)
• Штамм: Welgevonden (Велгевонден). Этот штамм был получен от клещей и сохранен мышами. Самое большое отличие между геномом Е-руминантиум и другими представителями Риккетсия Руминантиум - это наличие большого числа повторяющихся последовательностей. Такие повторения составляют 8,5% от генома и состоят из простых повторений последовательностей (SSR), больших тандемных дупликаций и перемещающихся (деспергированных) повторений. Эти повторения ассоциируются с 29-тью из 32-ух псевдогенов которые, похоже что возникают в основном в процессе (тандемной) дупликации. В дополнении, считается что SSR-ы (single sequencing reaction - единичные последовательные реакции) могут играть роль в регуляции или фазовой вариации (расщепление на два варианта). Полагается, что между 10-15% генов свободно живущие бактерии приобретаются в результате горизонтальной передачи гена.
• Входящий номер генома: CR925678 Образец в наличие в Европейской Лаборатории Молекулярной Биологии.
• Таксономия (биосистематика): 254945
• Схематическое представление организации бактерии создано впервые Тодом Гроесбеком, Национальный центр биотехнологии и информации. Существующий (настоящий) образ вида недоступен.
• Геномный Проект / Исследование Генома: Севенирование Генома (определение первичной структуры макромолекул)для Вида Эрлихия руминантиум, штамм - Велгевонден, в Университете Претории, Южная Африка - Завершено .Идентификационный номер проекта: 9614

  Информация о геноме:

• Название RefSeq
• Таксономия в базе GenBank
• Длина 1.51635 п.о. (пары оснований / пары нуклеотидов).
• GC блок (Содержание гуанина и цитозина )27,5% в ДНК
• Cодержит888 Протеин.
• РНК имеет трехмерную структуру TaxMap CDD COG
• Хромосомы NC_006832
• СR 005295

При создании сайта использовались информация c ресурсов EBI и ECBI

Перевод статей © Пертова Светлана,2007