Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес
оригинального документа
: http://kodomo.cmm.msu.ru/~reshetov/t2_files/interpro.html
Дата изменения: Fri May 20 21:05:38 2005 Дата индексирования: Tue Oct 2 13:18:01 2012 Кодировка: Windows-1251 |
|
|
Как мы видим, в InterPro есть много подписей, таких что все белки, им удовлетворяющие, описываются данной (IPR001789).
В то же время есть подписи не перекрывающиеся с данной по белкам на 100%. Только одна подпись перекрывается с IPR001789 по
описанным в них аминокислотам.
Эта подпись (IPR008327), считается родительской.
| |
Дерево родства | |
IPR001789 : Response regulator receiver FOUND IN: (IPR006291:Heavy metal response regulator, IPR008246:Response regulator, LytTR DNA-binding AlgR/VirR/ComE type, IPR008247:Response regulator of citrate/malate metabolism, IPR008248:Chemotaxis response regulator, CheB type, IPR008327:Response regulator antiterminator, IPR008328:Response regulator with an HD-GYP region, IPR008329:Response regulator, RegA/PrrA/ActR type, IPR009184:Tripartite hybrid signal transduction histidine kinase, BarA type, IPR009219:Bacteriophytochrome, CheY-like, IPR010114:Nitrogen regulation protein NR(I), IPR011376:Response regulator of heterocyst pattern formation PatA, IPR011879:Phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB, IPR012052:Sporulation response regulator, Spo0A) |
Описание всех известных подписей о белке CHEY_ECOLI, собранные в БД InterPro |
Название подписи | Положение в последовательности CHEY_ECOLI | Полное название базы данных | Название организации, поддерживающей данную БД. Страна и город | |
Response_reg | 6-124 | ProDom | Centre de Toulouse | Франция, Тулуза |
response_reg | 5-127 | Pfam | Sanger Institute | Англия, Хингстон |
RESPONSE_REGULATORY | 6-123 | prosite | Swiss Institute of Bioinformatics | Швейцария, Женева |
HTHFIS | 18-35; 123-128 | Sprint | University of Manchester Bioinformatics Education and Research | Англия, Манчестер |
CheY_like | 3-125 | Superfamily | The Laboratory of Molecular Biology | Англия, Кембридж |