Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~siniy/page_8.htm
Дата изменения: Wed Dec 17 19:55:42 2003
Дата индексирования: Mon Oct 1 22:09:42 2012
Кодировка: Windows-1251
Фрагмент вторичной структуры

Фрагмент вторичной структуры

Работа с програмой Rasmol

Исследовалось положение водородных связей на участке 184-219, и так уж исторически склалось что на этом участке присутствуют две альфа-спирали и антипараллельный бета-слой. Выявлен патерн водородных связей для альфа спирали.

Изображение участка

Водородные связи отмечены зелеными пунктирными линиями

Патерн водородных связей для альфа-спирали:
H(i-i+4)
Сb атомы расположены строго вне спирали.

В антипараллельном ?-слое нет столь четкого правила, но тем не менее видно, что связи идут через 1-2 и последовательности аминокислот в соседних тяжах противоположна направлена.
Cb атомы расположены по разные стороны от слоя и не обнаруживаются между тяжами.

На главную