Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~step/setup/S.pyogenes/Stepnov_Cr3.doc Дата изменения: Thu Dec 28 17:03:23 2006 Дата индексирования: Sat Dec 22 07:04:07 2007 Кодировка: koi8-r

АНАЛИЗ ПРОТЕОМА БАКТЕРИИ S.PYOGENS, ШТАММ М1 GAS

Введение.

[Русское название]

Русское название бактерии Streptococcus pyogens - Стрептококк
гемолитический.

[Таксономия]
Вид S.PYOGENS относится к роду Streptococcus, семейству Streptococcaceae,
порядку Lactobacillales, классу Bacilli, отряду Firmicutes и цартсву
Bacteria.
[Размер, фотография]

S.pyogens имеет шаровидную или эллипсоидную форму, клетки объединяются в
пары или цепи. Бактерия неподвижная. Размер бактерии лежит в пределах от
0.6 до 1 мкм.

вид бактерии под микроскопом (взята с сайта
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez)

[pic]


[Среда (среды) обитания и условия]

Все S.pyogens - это бактерии, паразитирующие в носоглоточной флоре человек.
Следовательно, место обитания этих патогенных организмов - это человек.
Оптимальная температура для S.pyogenes 30-35С. S.pyogens - это мезофил,
т.е. организм, нормально существующий и размножающийся при средних
температурных условиях 20-40С. Не галофил, т.е. S.pyogenes не переносит
места с повышенным содержанием соли.

[Чем интересна человеку, почему ее геном секвенирован]


S.pyogenes - это грамположительная (т.е. в муреиновую сетку встроены
другие компоненты: полисахариды, белки.), аэротолерантная анаэробная
бактерия. Интересна же она человеку тем, что она является одним из наиболее
встречающихся патогенных организмов человека. В обычном человеке от 5 до
15% (большая часть S.pyogenes находится в дыхательных путях) от всех
бактерий составляет S.pyogenes, причем при таком кол-ве в организме
человека, нет никаких признаков заболевания. Но если бактерия попадает на
«уязвимые» ткани, она может вызвать гнойное поражение их.
Все S.pyogenes делят на двенадцать основных групп
A,B,C,D,E,F,G,H,K,L,M и N(Классификация по Лансфилду). S.pyogenes M1 GAS
относится к группе A, вызывающей наибольшее число гноеродных заболеваний
человека.
Но существует и другая классификация по тому насколько много бактерия
выделяет гемолиза, который убивает лейкоциты. Бета
В прошлом столетии S.pyogenes унесла очень много жизней особенно после
того, как она явилась причиной «родильной горячкой» (сепсис после родов).
Когда-то скарлатина была тяжелым осложнением стрептококковой инфекции. Так
же как и «родильная горячка» раньше была опасно «рожистое воспаление»
(форма целлюлита с приступами лихорадки и полной токсикации). Но сейчас это
уже не опасно.
Однако и сейчас хватает разнообразных суровых последствий инфекционных
заболеваний S.pyogenes, а также «выход на поверхность» инвазивных
заболеваний вызываемых этой же бактерией.
Но наиболее страшное заболеванием - это «некротический фасцит». Это
заболевание убивает клетки тела, распространяется по тканям со скоростью 3
часа - один сантиметр. 25% процентов жертв умирают, а в наиболее страшных
случаях жертва умирает через 18 часов после инфекционирования. И бактерия,
вызывающая такие последствия - это S.pyogenes M1 GAS.
Не трудно понять из всего выше сказанного для чего был секвентирован
геном S.pyogenes M1.

Для отбора статей о среде обитания бактерии БД PubMed было составлено
(Streptococcus pyogenes[title] or S*pyogenes[title]) and habitat. В БД
PubMed по запросу найдено 1 статья.Как раз подходящая.

Геном и протеом S.pyogens


[Статистические данные о геноме]
Статистические данные о геноме приведены в табл.1 Они взяты с сайта
http://www.ebi.ac.uk/genomes/bacteria.html

Табл.1 Статистические данные о геноме S.pyogens
|Хромосома |Число пар |Число |Суммарная |Суммарная |GC |
|или |нуклеотидов |генов |длина генов|длина |состав |
|плазмида | | |(% от длины|межгенных |(%) |
| | | |хромосомы) |промежутков | |
| | | | |(%) | |
|хр.1 |1852441 |1 697 |83,82% |16,18% |38,5% |
|кольцевая | | | | | |


[Длины белков]
По данным с сайта http://www.ebi.ac.uk/genomes/bacteria.html число белков
протеома S.piogenes M1 GAS совпадает с числом генов 1697. По-видимому,
считали количество генов по количеству известных белков. Поэтому гены,
синтез белка с которых по каким-либо причинам блокирован, не были
распознаны.




Литература

http://www.ncbi.nlm.nih.gov
http://www.ebi.ac.uk
http://www.textbookofbacteriology.net/
http://www.ebi.ac.uk/genomes/bacteria.html