Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~student08fbb/torsion.html
Дата изменения: Mon Dec 29 15:20:40 2008
Дата индексирования: Tue Oct 2 03:50:33 2012
Кодировка: Windows-1251

Торсионные углы.

Учебный сайт Шиндяпиной А.В.

Торсионные углы. Карты Рамачандрана.

Торсионные углы

В белке можно рассчитать два торсионных угла:
- Phi - угол вращения по связи С-Са
- Psi - угол вращения по связи Са-N
Очевидно. что на N-конце белка не рассчитываются phi-углы, а на С-конце не рассчитываются psi-углы.

Карты Рамачандрана

Используя данные по phi- и psi-углам, взятые с моего белка PTHP_E.coli, я построила точечные диаграммы ( по совместительству карты Рамачандрана)

Места, где наибольшее скопление точек и есть области значений наиболее типичных торсионных углов. Как видно, для бета-структуры такими являются:
phi от -150 до -60 ;
psi от 120 до 160 .

На диаграмме, построенной на основе данных о торсионных углах во всем белке, имеется две области "разрешенных" торсионных углов. Они отвечают бета-структуре:
phi от -160 до -50;
psi от 110 до 150.
и альфа-спирали, где типичны следующие значения углов:
phi от -110 до -50
psi от -50 до 0,4.
Диаграмма наглядно иллюстрирует "альфа+бета" структуру белка. Выпадающие из "разршенных зон" точки соотвествуют остаткам глицина и пролина.

©, "ООО Шиндяпина 2008"