Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.su/FBB/year_02/science_1/otzyvy/onFomichev.doc Дата изменения: Tue Nov 18 12:54:13 2003 Дата индексирования: Tue Oct 2 00:47:56 2012 Кодировка: koi8-r

Рецензия

на курсовую работу Фомичёва Р.Н.- студента 2 курса факультета Биоинженерии
и биоинформатики Московского государственного университета им. М.В.
Ломоносова.

Курсовая работа Фомичёва Р.Н. на тему «Молекулярная динамика комплекса
тетрациклина с 30S рибосомной субчастицой» принадлежит к чрезвычайно
интересной и динамичной развивающейся области молекулярной биологии -
структурной биологии. Фантастические успехи в области установления
третичных структур биополимеров ставят перед исследователями новые вопросы
- не только о статической структуре биополимера, но и о динамике движения
элементов структуры в растворе. В связи с растущей вычислительной мощностью
современных компьютеров данные о динамике биополимеров теперь можно
моделировать теоретическими расчетами в разумном интервале времени. Подходы
к моделированию взаимодействий типа белок-лиганд активно разрабатываются в
ведущих лабораториях мира. Публикации по данной тематике находят свое место
на страницах научных журналов с самым высоким уровнем цитируемости.

В первой части работы описано получения файлов топологии для не
стандартного соединения (Тетрациклин) и последующее построение суммарных
файлов координат и топологий. На основе полученной модели студент провел
симуляцию МД комплекса тетрациклина с фрагментом рРНК в растворе. Тут
необходимо заметить, что применение МД по отношению ко всей 30S субчастице
не представляется возможным из-за большого количества атомов. Поэтому,
использование ограниченного окружения представляется разумным, как
первоначальный подход к решению вопроса о структурной специфичности
тетрациклина.
Фомичёв Р.Н. проявил себя как любознательный и заинтересованный
исследователь. Благодаря высокой организованности и работоспособности
Фомичёва Р.Н. работа была сделана вовремя и качественно. Мы надеемся на
дальнейшее плодотворное сотрудничество.
Абсолютно очевидно, что студент овладел самыми современными методами
оптимизации контактов и разбирается в научной литературе по данному
вопросу. Курсовая работа Фомичёва Р.Н. заслуживает отличной оценки.

М.н.с, к.х.н. Головин А.В.