Упражнения по работе в пакете EMBOSS

Все команды выполняйте в специальной поддиректории на pvm. Не забывайте вести протокол. По окончании работы скопируйте все нужные файлы в соответствующую директорию на диске H.

1. Сохраните последовательность из записи банка EMBL с номером доступа (AC) M32293 в форматах: fasta, embl, genbank, gcg, pir, ncbi.

   Подсказка: программа seqret.

2. Программой entret возьмите из банка EMBL полную запись M32293. Определите границы кодирующего участка. Посчитайте нуклеотидный состав этого участка и 3'-концевой по отношению к этому участку части последовательности.

   Подсказки. Границы кодирующего участка определите по полю FT. Чтобы выяснить название программы, считающей нуклеотидный состав, выполните "wossname composition". Запустите эту программу с параметром -help, чтобы выяснить нужные параметры (не забывайте про существование знаков >, |, & и команды more). Выделение нужного участка — опциями -sbegin, -send или квадратными скобками (если будете пользоваться последними, помните, что это спецсимволы tcsh!).