Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес
оригинального документа
: http://kodomo.cmm.msu.su/~siniy/page_8.htm
Дата изменения: Wed Dec 17 19:55:42 2003 Дата индексирования: Mon Oct 1 19:53:26 2012 Кодировка: Windows-1251 |
Фрагмент вторичной структуры
Работа с програмой Rasmol
Исследовалось положение водородных связей на участке 184-219, и так уж исторически склалось что на этом участке присутствуют две альфа-спирали и антипараллельный бета-слой. Выявлен патерн водородных связей для альфа спирали.
Изображение участка
Водородные связи отмечены зелеными пунктирными линиями
Патерн водородных связей для альфа-спирали:
H(i-i+4)
Сb атомы расположены строго вне спирали.
В антипараллельном ?-слое нет столь четкого правила, но тем не менее видно, что связи идут через 1-2 и последовательности аминокислот в соседних тяжах противоположна направлена.
Cb атомы расположены по разные стороны от слоя и не обнаруживаются между тяжами.