Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.fbb.msu.ru/FBB/year_04/doc/task12.doc
Дата изменения: Wed Dec 8 22:28:21 2004
Дата индексирования: Tue Oct 2 01:25:04 2012
Кодировка: koi8-r


Практикум 12



Часть 1. Создаем макет сайта с отчетом за первый семестр

Внимание: работаем все время в директории Practice11


1. Создаем заглавную страничку первого семестра

Имя файла "term1.html". Название страницы - "Term1".
Заголовок текста - «Первый семестр». Заголовок выровнен по центру.
Далее поместите оглавление, оформленное в виде многоуровневого списка:
. Общие сведения о белке ****_ECOLI
. Исследование пространственной структуры белка (PDB-код ****)
. Общее описание 3D-структуры
. Описание вторичной структуры
. Описание области контакта с функциональным лигандом
. Аланилаланилаланин (работа с ACD/ChemSketch)
. Поиск в Интернете :
. химический элемент ххххххххх;
. кто такой уууууууууууууууууу?

Когда Вы уже создадите все странички отчета, между заголовком и списком
поместите небольшой текст (2-3 строки), в котором объясните, чему вы
реально научились в течение семестра (мы понимаем, что это не то же самое,
чему мы вас учили). Отметьте, что показалось полезным, интересным, скучным
и т.п.


2. Создаем связи между готовыми страничками

На страничке term1.html превратите соответствующие пункты оглавления в
работающие гиперссылки на соответствующие страницы.
На каждой из готовых страниц создайте обратную гиперссылку на стр.
term1.html, например, «На главную страницу первого семестра». Ее разумно
разместить в правом/левом верхнем углу, чтобы читателю не нужно было ее
долго искать.
Проверьте работу всех гиперссылок!


Часть 2. Доделываем странички отчета за первый семестр


1. Создайте страничку с описанием общих характеристик белка по данным
Вашего отчета за первый блок.

Название страницы - XXXX_ECOLI (краткое название Вашего белка).
Заголовок текста - полное русское название белка, а в скобках полное
английское (заголовок выровнен по центру).
Совет: не стесняйтесь спросить преподавателя, как называется Ваш белок по-
русски.
Далее поместите текст, оформленный как список:
. Краткое название белка - XXXX_ECOLI
. Полное название организма - Escherichia coli , K-12
. Название гена - xxxX.
. Номер локуса в бактериальной хромосоме - x00000
. Последовательность в формате FASTA: (преформатированный текст, который
лучше к тому же поместить в прямоугольник с чуть отличающимся фоном. Как
изготовить такой прямоугольник, попробуйте сообразить сами!)
Для отображения длинного тире используйте спецсимвол, см. подсказки.
Далее поместите заголовок «Мои вычисления с помощью Excel».
Совет: этот заголовок должен быть более низкого уровня по отношению к
заголовку страницы.

Далее поместите таблицу, состоящую из одной строки и 2-х столбцов.
В левую ячейку поместите заголовок "аминокислотный состав белка" и таблицу
с аминокислотным составом, а в правую текст следующего вида:
Длина последовательности - 999 а.о.
Молярная масса - 100000 г/моль.
Средний заряд молекулы при рН=7.0 - 0,00.
Отношение содержания гидрофобных остатков (список) к содержанию
гидрофильных (список) - .., что позволяет думать, что данный белок является
(или не является) мембранным.
Совет: Вам нужно создать таблицу вида:
| А (аланин) |10,2% |
|С (цистеин) |0,5% |

Удобнее всего написать аккуратно теги для первых 2-х строк, проверить их,
затем путем копирования создать таблицу нужного размера, и только потом
внести в нее нужную Вам информацию, заменяя числа и названия а.о.
Создав эту и следующие странички, оформляйте соответствующий пункт
оглавления на страничке Term1 как гиперссылку.


2. Создайте страничку (3D.html) с общим описанием 3D-структуры Вашего
белка.

Название страницы - «3D».
Заголовок текста - «Описание пространственной структуры ..(название белка)
по данным банка PDB, код 0XXX». Заголовок выровнен по центру.
Далее поместите таблицу, состоящую из одной строки и 2-х столбцов. В левую
ячейку поместите изображение Вашего белка, а в правую ( текст, объясняющий,
что же, собственно говоря, изображено на рисунке.
Дополнительно: между заголовком и таблицей поместите текст с общими
характеристиками данной структуры, описанными в Вашем отчете.
Дополнительно: добавьте к таблице вторую строчку: в левую ячейку вставьте
элемент PRE (преформатирование) и в него скопируйте текст скрипта, а в
правой ( напишите, для чего создан этот скрипт.


3. Создайте страничку (secondary_structure.html) с описанием вторичной
структуры Вашего белка.

Название страницы - «Secondary structure».
Заголовок текста - «Описание вторичной структуры ..(название белка)».
Заголовок выровнен по центру.
Далее поместите таблицу, состоящую из одной строки и 2-х столбцов. В левую
ячейку поместите изображение вторичной структуры Вашего белка, в правую (
текст, объясняющий условные обозначения, а также метод, с помощью которого
Вы определяли вторичную структуру.


4. Создайте страничку (ligand.html) с описанием области связывания лиганда.

Название страницы - «Ligand».
Заголовок текста - «Изображение области связывания (название лиганда) с
(название белка)». Заголовок выровнен по центру.
Далее поместите таблицу, состоящую из одной строки и 2-х столбцов. В левую
ячейку поместите изображение области, в правую ячейку ( текст,
объясняющий условные обозначения, а также метод, с помощью которого Вы
выделяли данную область.
Дополнительно: Поместите ниже (под соответствующим заголовком) описание
Вашего плана генноинженерного эксперимента.