Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.fbb.msu.ru/FBB/StudentScience/themes_2007s/N_Kalinina(2).doc Дата изменения: Wed Jan 31 20:30:22 2007 Дата индексирования: Tue Oct 2 12:40:01 2012 Кодировка: koi8-r

Темы для курсовых работ студентов факультета биоинженерии и
биоинформатики
Калинина Наталья Олеговна тел. раб. 939-53-66
e-mail: kalinina@belozersky.msu.ru , kalinina@genebee.msu.ru
корпус А: ком.627


Модель пространственной структуры функциональных доменов вирусного
транспортного белка
В геноме вирусов растений имеется один или несколько генов, кодирующих
специальные белки, которые обеспечивают транспорт вирусного генома из
клетки в клетку и по проводящей системе растения (так называемые
транспортные белки). Транспортные белки вирусов мультифункциональны.
Известно, что они взаимодействуют с нуклеиновой кислотой вируса, образуя
транспортный рибонуклеопротеидный комплекс (вирусный РНП-комплекс) и с
другими вирусными и клеточными белками. До настоящего времени отсутствуют
данные о структурной организации этих белков, хотя для ряда вирусов
функциональные домены транспортных белков хорошо охарактеризованы.
В нашей лаборатории показано, что транспортный белок гордеивируса
полулатентного вируса мятлика (63К белок), формирующий вирусный РНП-
комплекс, состоит из трех доменов. Два домена являются РНК-связывающими,
третий домен обладает активностями НТФазы/ РНК хеликазы. Замены аминокислот
внутри доменов по-разному влияют на транспортную функцию 63К белка.
Целью работы является построение модели пространственной структуры
функциональных доменов 63К белка и ее экспериментальная проверка (при
наличии времени для экспериментальной работы).




Биохимические свойства РНК-связывающих доменов в составе транспортного
белка вируса растений
В геноме вирусов растений имеется один или несколько генов,
кодирующих специальные белки, которые обеспечивают транспорт вирусного
генома из клетки в клетку и по проводящей системе растения (так называемые
транспортные белки). Транспортные белки некоторых вирусов взаимодействуют с
нуклеиновой кислотой вируса, образуя транспортный рибонуклеопротеидный
комплекс (невирионный вирусный РНП-комплекс).
В нашей лаборатории показано, что транспортный белок гордеивируса
полулатентного вируса мятлика (63К белок), формирующий вирусный РНП-
комплекс, состоит из трех доменов. Предполагается, что два РНК-связывающих
домена, локализованные в N-концевой половине этого белка, выполняют
структурную роль при образовании РНП-комплекса, тогда как третий домен,
обладающий активностями НТФазы/ РНК хеликазы, принимает участие в
ремоделировании РНП-комплекса в процессе его транспорта из клетки в клетку.
Строение N-концевой половины 63К белка сходно со строением клеточного
информосомо-образующего белка YB-1, выполняющего в клетке сходные функции -
маскирование и трансляционную активацию мРНК.
Цель работы заключается в изучении биохимических свойств двух
доменов, входящих в N-концевую половину 63К белка, а именно специфической и
неспецифической РНК-связывающей активности, возможности фосфорилирования и
влияния этой модификации на РНК-связывающие свойства доменов.