Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.fbb.msu.ru/FBB/StudentScience/themes_2008s/Sutormin.txt Дата изменения: Wed Jan 30 16:27:04 2008 Дата индексирования: Tue Oct 2 12:22:37 2012 Кодировка: Windows-1251

Считается, что делеции или вставки в альфа-спиралях белков являются
событиями редкими, но исследование этого вопроса говорит об обратном.
Известны случаи, подтвержденные структурными выравниваниями, когда
делеция или вставка одного аминокислотного остатка в альфа-спираль
приводит лишь к удлиннению или укорочению одного витка спирали, в
целом ее не портя. С другой стороны бытует соображение, что проще
удалить целый виток спирали, что приведет к укорочению спирали, но
почти не изменит распределение остатков относительно остального белка.
Эти вопросы почти не изучены. Кроме того нет хорошей модели,
описывающей изменение вероятностей длин делеций/вставок с течением
эволюционного времени. Ясно, что более губокая проработка вопросов,
связанных с частотами делеций позволила бы уточнить алгоритмы
выравниваний, т.к. эти алгоритмы должны использовать различные оценки
штрафов за делеции в различных элементах вторичной структуры белка.
Задача, предлагаемая в данной работе, состоит в статистическом и
эволюционном исследовании распределения длин делеций в альфа-спиралях.