Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.fbb.msu.ru/FBB/StudentScience/themes_2009s/Chernorizov.doc Дата изменения: Mon Mar 16 12:57:56 2009 Дата индексирования: Tue Oct 2 12:34:57 2012 Кодировка: koi8-r

Тема курсовой работы для студента 3-4 курса:


Изучение и модуляция белок-белковых контактов шаперонов Hsp/Hsc70.



Тьютор: асп.Черноризов Кирилл

Для правильного сворачивания белковых структур в клетке существует система
шаперонов, к которой в частности относятся белки теплового шока Hsp70 и
Hsp40. Hsp70 способен связывать иммуногенные для злокачественных опухолевых
клеток белки и, оказавшись в межклеточном пространстве, подставлять клетку-
хозяина под действие иммунной системы. Индукция выхода Hsp70 из клетки
является важным терапевтическим эффектом, так как внеклеточный Hsp70 может
использоваться в качестве маркера клеток, пораженных раком, для их
дальнейшего точечного уничтожения иммунной системой организма. Также Hsp70
задействован в развитии ряда так называемых конформационных
нейродегенеративных заболеваний (Болезнь Альцгеймера, хорея Хантингтона,
болезнь Паркинсона и пр.)

Основным направлением исследования является in silico поиск способов
модуляции взаимодействия Hsp/Hsc70 со своим кошапероном Hsp40, фактором
нуклеотидного обмена Bag-1, и с фактором теплового шока HSF на уровне белок-
белковых контактов. Целью работы является поиск способа управлять
функционированием белка Hsp/Hsc70 за счет вмешательство во взаимодействия с
белками, необходимыми для его функционирования.

Предполагается провести тщательный анализ литературных источников с целью
создать максимально подробную схему регуляцию функционирования Hsp70 на
уровне белок-белковых взаимодействий (таких как образование комплексов
Hsp70/Bag-1, Hsp70/Hsp40, Hsp70/HSF, Hsp70/HiP). В процессе исполнения
курсовой работу предполагается освоение навыков работы с первичными
последовательностями, анализ 3-хмерных структур, молекулярный докинг, метод
симуляции молекулярной динамики, белок-белковый докинг, молекулярное
моделирование.

Требование к студенту:

- базовые знания в области биоинформатики (общие представления о
молекулярной динамике и молекулярном моделировании);

- знание английского языка на уровне, позволяющем без особых затруднений
читать научные статьи.

- пытливый ум и самостоятельность



Контактная информация: МГУ, лабораторный корпус Б, комн.622;
kirill.chernorizov@gmail.com