Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.fbb.msu.ru/hg/allpy/raw-rev/a3df15a42f9d Дата изменения: Unknown Дата индексирования: Tue Oct 2 07:59:15 2012 Кодировка:

# HG changeset patch
# User boris (kodomo)
# Date 1298732805 -10800
# Node ID a3df15a42f9d2d5180ed044289662544efb5d5fd
# Parent 1785e40b2a2d5f1532a78352c93bc00bae7a00bf
blocks3d(): fix a bug

when finding pair cores, all alternative cores should be considered!!

diff -r 1785e40b2a2d -r a3df15a42f9d allpy/structure.py
--- a/allpy/structure.py Sat Feb 26 18:05:10 2011 +0300
+++ b/allpy/structure.py Sat Feb 26 18:06:45 2011 +0300
@@ -275,7 +275,8 @@
block = copy(self)
block.sequences = [seq1, seq2]
cores = block.geometrical_cores(max_delta=max_delta,
- timeout=timeout, minsize=min_width)
+ timeout=timeout, minsize=min_width,
+ ac_new_atoms=0.0, ac_count=0)
for core in cores:
core_block = copy(block)
core_block.columns = sorted(core, key=column2pos.get)