Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.fbb.msu.ru/~xedin/Term2/Practice3/srs_tables.doc Дата изменения: Tue Mar 6 18:09:49 2007 Дата индексирования: Tue Oct 2 11:31:11 2012 Кодировка: koi8-r

Таблица 1. Группы банков данных
|Банк данных |Группа |
|MedLine |Literature, Bibliography and Reference Databases |
|UniProtKB |UniProt Universal Protein Resource |
|UniRef100 |UniProt Universal Protein Resource |
|EMBL |Nucleotide sequence databases |
|PDB |Protein function, structure and interaction databases |


Таблица 2. Таксон "гамма-протеобактерии"

|Латинское название таксона |gammaproteobacteria |
|Количество документов в |43434 |
|Swiss-Prot | |



Таблица 3. Запросы

|Цель |Строка запроса |Количество найденных |
| | |документов |
|Найти белок с |(([swissprot-AccNumber:P00452*] | |1 |
|данными AC |[swissprot-AccNumber:P78088*]) | | |
|(у RIR1_E.coli их |[swissprot-AccNumber:P78177*]) | |
|несколько) | | |
|Найти все документы,|(([swissprot-Taxonomy:gammaproteoba|16 |
|описывающие белки из|cteria*] & | |
|таксона |(([swissprot-Description:Ribonucleo| |
|"гамма-протеобактери|side-diphosphate*] & | |
|и", которые в поле |[swissprot-Description:reductase*])| |
|DE содержат нечто, || | |
|достаточно сходное с|[swissprot-Description:Ribonucleosi| |
|описанием функции |de-diphosphate reductase *])) & | |
|RIR1_E.coli |([swissprot-AccNumber:*] ! | |
| |[swissprot-AccNumber:P00452*])) | |
|Найти одним запросом|(([uniref100-Organism:Yersinia |8 |
|к банку UniRef100 |pestis*] | | |
|белки из организмов |[uniref100-Organism:Vibrio | |
|Yersinia pestis и |cholerae*]) & | |
|Vibrio cholerae, |([uniref100-Description:Ribonucleos| |
|которые выполняют |ide-diphosphate*] & | |
|функцию, сходную с |[uniref100-Description:reductase*])| |
|функцией RIR1_E.coli|) | |
|Найти ссылки на |((([medline-AllText:Ribonucleoside-|10* |
|статьи, в которых |diphosphate*] & | |
|упоминается полное |[medline-AllText:reductase*]) & | |
|название |[medline-AllText:1]) | | |
|RIR1_E.coli. |[medline-AllText:Ribonucleoside-dip| |
|(Ribonucleoside-diph|hosphate reductase 1*]) | |
|osphate reductase 1)| | |
| |[medline-AllText:EC 1.17.4.1] |227 |
|Найти ссылки на |([medline-PubDate#19600101:19700101|6 |
|статьи, в написании |] & | |
|которых учавствовал |[medline-Authors:neyfakh*,a.a.*]) | |
|Нейфах А.А. в 1970-е| | |
|годы | | |


*- если брать название белка в кавычки, т.е. искать все слова вместе, то не
находится ни одной статьи.

Если брать другие названия RIR1_E.coli, то поиск результатов не дает.

Таблица 4. Описание выборки

|? |ID |AC |Организм |Таксон |
|1 |RIR1_BUCAI |P57276 |BUCHNERA |BACTERIA PROTEOBACTERIA |
| | | |APHIDICOLA SUBSP |GAMMAPROTEOBACTERIA |
| | | |ACYRTHOSIPHON |ENTEROBACTERIALES ENTEROBACTERIACEAE|
| | | |PISUM |BUCHNERA |
| | | |ACYRTHOSIPHON | |
| | | |PISUM SYMBIOTIC | |
| | | |BACTERIUM | |
|2 |RIR1_BUCAP |Q8K9W3 |BUCHNERA |BACTERIA PROTEOBACTERIA |
| | | |APHIDICOLA SUBSP |GAMMAPROTEOBACTERIA |
| | | |SCHIZAPHIS |ENTEROBACTERIALES ENTEROBACTERIACEAE|
| | | |GRAMINUM |BUCHNERA |
|3 |RIR1_BUCBP |Q89AS4 |BUCHNERA |BACTERIA PROTEOBACTERIA |
| | | |APHIDICOLA SUBSP |GAMMAPROTEOBACTERIA |
| | | |BAIZONGIA |ENTEROBACTERIALES ENTEROBACTERIACEAE|
| | | |PISTACIAE |BUCHNERA |
|4 |RIR1_HAEIN |P43754 |HAEMOPHILUS |BACTERIA PROTEOBACTERIA |
| | | |INFLUENZAE |GAMMAPROTEOBACTERIA PASTEURELLALES |
| | | | |PASTEURELLACEAE HAEMOPHILUS |
|5 |RIR1_SALTY |P37426 |SALMONELLA |BACTERIA PROTEOBACTERIA |
| | | |TYPHIMURIUM |GAMMAPROTEOBACTERIA |
| | | | |ENTEROBACTERIALES ENTEROBACTERIACEAE|
| | | | |SALMONELLA |
|6 |RIR2_BUCAI |P57275 |BUCHNERA |BACTERIA PROTEOBACTERIA |
| | | |APHIDICOLA SUBSP |GAMMAPROTEOBACTERIA |
| | | |ACYRTHOSIPHON |ENTEROBACTERIALES ENTEROBACTERIACEAE|
| | | |PISUM |BUCHNERA |
| | | |ACYRTHOSIPHON | |
| | | |PISUM SYMBIOTIC | |
| | | |BACTERIUM | |
|7 |RIR2_BUCAP |Q8K9W4 |BUCHNERA |BACTERIA PROTEOBACTERIA |
| | | |APHIDICOLA SUBSP |GAMMAPROTEOBACTERIA |
| | | |SCHIZAPHIS |ENTEROBACTERIALES ENTEROBACTERIACEAE|
| | | |GRAMINUM |BUCHNERA |
|8 |RIR2_BUCBP |Q89AS5 |BUCHNERA |BACTERIA PROTEOBACTERIA |
| | | |APHIDICOLA SUBSP |GAMMAPROTEOBACTERIA |
| | | |BAIZONGIA |ENTEROBACTERIALES ENTEROBACTERIACEAE|
| | | |PISTACIAE |BUCHNERA |
|9 |RIR2_ECO57 |P69925 |ESCHERICHIA COLI |BACTERIA PROTEOBACTERIA |
| | |P00453 |O157:H7 |GAMMAPROTEOBACTERIA |
| | | | |ENTEROBACTERIALES ENTEROBACTERIACEAE|
| | | | |ESCHERICHIA |
|10 |RIR2_ECOLI |P69924 |ESCHERICHIA COLI |BACTERIA PROTEOBACTERIA |
| | |P00453 | |GAMMAPROTEOBACTERIA |
| | | | |ENTEROBACTERIALES ENTEROBACTERIACEAE|
| | | | |ESCHERICHIA |
|11 |RIR2_HAEIN |P43755 |HAEMOPHILUS |BACTERIA PROTEOBACTERIA |
| | | |INFLUENZAE |GAMMAPROTEOBACTERIA PASTEURELLALES |
| | | | |PASTEURELLACEAE HAEMOPHILUS |
|121|RIR2_SALTY |P37427 |SALMONELLA |BACTERIA PROTEOBACTERIA |
|3 | | |TYPHIMURIUM |GAMMAPROTEOBACTERIA |
| | | | |ENTEROBACTERIALES ENTEROBACTERIACEAE|
| | | | |SALMONELLA |
|14 |RIR3_ECOLI |P39452 |ESCHERICHIA COLI |BACTERIA PROTEOBACTERIA |
| | |P78101 | |GAMMAPROTEOBACTERIA |
| | |P78210 | |ENTEROBACTERIALES ENTEROBACTERIACEAE|
| | |P78211 | |ESCHERICHIA |
| | |Q59417 | | |
|15 |RIR3_SALTY |Q08698 |SALMONELLA |BACTERIA PROTEOBACTERIA |
| | | |TYPHIMURIUM |GAMMAPROTEOBACTERIA |
| | | | |ENTEROBACTERIALES ENTEROBACTERIACEAE|
| | | | |SALMONELLA |
|16 |RIR4_ECOLI |P37146 |ESCHERICHIA COLI |BACTERIA PROTEOBACTERIA |
| | |P78244 | |GAMMAPROTEOBACTERIA |
| | | | |ENTEROBACTERIALES ENTEROBACTERIACEAE|
| | | | |ESCHERICHIA |