Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.fbb.msu.ru/~sorochkinaa/term2/matrix.html
Дата изменения: Mon Apr 17 17:40:46 2006
Дата индексирования: Mon Oct 1 21:45:14 2012
Кодировка: Windows-1251

Матрицы замен Главная страница > Второй семестр

Матрицы замен

Изучение матрицы BLOSUM62
Средний вес замен между аминокислотами.
Веса аминокислотных замен рассчитаны для Ala, Asp и Arg.

Внутри группы NDEQ	2
Внутри группы KRH	2,22
Между группами NDEQ и KRH	0

Таким образом, внутри второй группы средний вес замен аминокислот больше, чем внутри первой, а оба значения больше среднего веса замен аминокислот между двумя группами.
Вычисление весов замен аминокислот на основе блока
Средний вес замен аминокислот:

A-A	7,45
A-R	3,08
A-N	-0,26

Аналогичные данные из матрицы blosum62:

A-A	4
A-R	-2
A-N	6

Таким образом, результаты расчетов относительно пар резко различаются с данными из матрицы blosum (причем у двух последних значений не совпадают знаки).