Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес
оригинального документа
: http://kodomo.fbb.msu.ru/~sorochkinaa/term4/ecoli_metja.html
Дата изменения: Mon Mar 26 23:04:12 2007 Дата индексирования: Mon Oct 1 22:12:00 2012 Кодировка: |
Header | |||
Program | needle | ||
Rundate | Sun Mar 25 2007 18:35:35 | ||
Align format | srspair | ||
Report file | temp_job3.needlep | ||
Results | |||
#======================================= # # Aligned_sequences: 2 # 1: SYY_ECOLI # 2: SYY_METJA # Matrix: EBLOSUM62 # Gap_penalty: 10.0 # Extend_penalty: 0.5 # # Length: 351 # Identity: 62/351 (17.7%) # Similarity: 113/351 (32.2%) # Gaps: 128/351 (36.5%) # Score: 88.5 # # #======================================= SYY_ECOLI 1 RLAQGPIALYCGFDPTADSLHLGHLVPLLCLKRFQQAGHKPVALVGGATG 50 ..:.|.||:|:. .:||||.:.:..:...|.||...:.|:. SYY_METJA 1 -----EKSAYIGFEPSG-KIHLGHYLQIKKMIDLQNAGFDIIILLA---- 40 SYY_ECOLI 51 LIGDPSFKAAERKLNTEETVQEWVDKIRKQVAPFLDFDCGENSAIAANNY 100 .|:.....:..:|:||| SYY_METJA 41 ------------DLHAYLNQKGELDEIRK--------------------- 57 SYY_ECOLI 101 DWFGNMNVLTF----LR---------DIGKHFSVNQMINKEAVKQRLN-- 135 .|:.|...| |: .:.|.:::| :.:.|:|..|. SYY_METJA 58 --IGDYNKKVFEAMGLKAKYVYGSEFQLDKDYTLN--VYRLALKTTLKRA 103 SYY_ECOLI 136 --------REDQGISFTEFSYNLLQGYDFACLNKQYGVVLQIGGSDQWGN 177 |||:.....|..|.::|..|...| ||.:.:||.:| SYY_METJA 104 RRSMELIAREDENPKVAEVIYPIMQVNDIHYL----GVDVAVGGMEQ--- 146 SYY_ECOLI 178 ITSGIDLTRRLHQ-------NQVFGLTVPLITKADGT-KFGKTEGGAVWL 219 |::|. .:|..:..|::|..||. |...::|..:.: SYY_METJA 147 --------RKIHMLARELLPKKVVCIHNPVLTGLDGEGKMSSSKGNFIAV 188 SYY_ECOLI 220 DP---------KKT---------SPYKFYQFWINTADADVYRFLKFFTFM 251 |. ||. :|......:.......:.|..||...: SYY_METJA 189 DDSPEEIRAKIKKAYCPAGVVEGNPIMEIAKYFLEYPLTIKRPEKFGGDL 238 SYY_ECOLI 252 SIEEINALEEEDKNSGKAPR-AQYVLAEQVTRLVHGEEGLQAAKRITECL 300 ::.....||...||....|. .:..:||::.:::. SYY_METJA 239 TVNSYEELESLFKNKELHPMDLKNAVAEELIKILE--------------- 273 SYY_ECOLI 301 F 301 SYY_METJA 273 - 273 |
|||
Additional Information | |||
![]() |
Terms of Use
![]() ![]() |
![]() |